More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1358 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  100 
 
 		 365 aa  743    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  53.95 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  53.39 
 
 		 359 aa  349  4e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  52.33 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.14 
 
 		 370 aa  338  9e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  49.59 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 380 aa  332  9e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.33 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.33 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  50.73 
 
 		 356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  47.96 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  47.7 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  48.47 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  47.85 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  47.91 
 
 		 355 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  47.72 
 
 		 369 aa  317  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  46.98 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  50.95 
 
 		 356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2865  ABC transporter related  48.01 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  46.13 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  47.5 
 
 		 370 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  45.28 
 
 		 403 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  46.51 
 
 		 382 aa  309  5e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  46.22 
 
 		 367 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  47.72 
 
 		 368 aa  308  8e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4866  ABC transporter related  45.05 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.112341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  45.15 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  45.9 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  44.74 
 
 		 371 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  46.54 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  44.86 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  45.72 
 
 		 381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  46.88 
 
 		 350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  46.88 
 
 		 350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  46.88 
 
 		 350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  48.94 
 
 		 381 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  43.01 
 
 		 378 aa  305  7e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  44.84 
 
 		 379 aa  305  8.000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  48.17 
 
 		 382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  45.9 
 
 		 369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  45.33 
 
 		 372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  44.59 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  45.7 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  43.55 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.31 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  43.77 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1445  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  43.8 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5875  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0109503  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  44.84 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  43.73 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  45.15 
 
 		 375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  46.18 
 
 		 349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  42.18 
 
 		 381 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  45.14 
 
 		 371 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  44.2 
 
 		 369 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  44.72 
 
 		 365 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  45.14 
 
 		 371 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  44.63 
 
 		 365 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  44.11 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  46.07 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  45.68 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.04 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  42.56 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  43.68 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  45.61 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  44.26 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.04 
 
 		 369 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  42.9 
 
 		 384 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  43.84 
 
 		 379 aa  299  5e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  44.11 
 
 		 365 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  44.11 
 
 		 365 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  43.98 
 
 		 335 aa  299  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1416  ABC transporter related  45.48 
 
 		 347 aa  299  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  43.31 
 
 		 370 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 360 aa  299  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  45.7 
 
 		 367 aa  298  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  43.65 
 
 		 376 aa  298  9e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  44.89 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  45.28 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  45.7 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  45.31 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  44.67 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  45.33 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  42.29 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  44.03 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  46.55 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  45.81 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  44.6 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.05 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.16 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>