More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03320 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  100 
 
 
368 aa  745    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2491  ABC transporter related protein  46.74 
 
 
379 aa  330  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  43.94 
 
 
364 aa  309  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2558  ABC transporter related  44.69 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2603  ABC transporter related  44.69 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2597  ABC transporter related  44.69 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  42.97 
 
 
379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  43.21 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  43.32 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  45.92 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  44.29 
 
 
370 aa  301  8.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  42.86 
 
 
363 aa  301  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  44.11 
 
 
365 aa  301  1e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  44.38 
 
 
352 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  44.29 
 
 
402 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  45.5 
 
 
381 aa  296  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  43.6 
 
 
367 aa  296  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  43.6 
 
 
367 aa  296  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  43.72 
 
 
355 aa  295  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  44.51 
 
 
356 aa  295  1e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  43.35 
 
 
375 aa  293  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  43.63 
 
 
372 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  43.58 
 
 
359 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  43.01 
 
 
381 aa  292  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5438  ABC transporter related protein  43.09 
 
 
369 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  41.33 
 
 
374 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  42.86 
 
 
369 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  41.82 
 
 
382 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
369 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  40.76 
 
 
366 aa  287  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  42.12 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  41.98 
 
 
369 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  42.23 
 
 
369 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  40.37 
 
 
365 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  39.95 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  42.55 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  40.6 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  40.5 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  41.51 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  40.77 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  42.51 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  42.9 
 
 
385 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  40.31 
 
 
418 aa  282  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  41.58 
 
 
353 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  42.16 
 
 
365 aa  282  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  42.16 
 
 
365 aa  282  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  42.47 
 
 
374 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  42.12 
 
 
366 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  42.86 
 
 
371 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  42.63 
 
 
373 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  44.51 
 
 
397 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
356 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  39.51 
 
 
365 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  42.67 
 
 
373 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
356 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.7 
 
 
369 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  41.03 
 
 
365 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
371 aa  280  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  43.47 
 
 
370 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2093  ABC transporter related  41.11 
 
 
380 aa  279  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  40.82 
 
 
356 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  40.71 
 
 
354 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  40.65 
 
 
372 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  41.73 
 
 
367 aa  279  6e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  38.5 
 
 
384 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  38.65 
 
 
371 aa  278  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  40.92 
 
 
353 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  45.7 
 
 
369 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03330  ABC transporter related  41.3 
 
 
378 aa  278  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  38.65 
 
 
384 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.19 
 
 
357 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.62 
 
 
370 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4075  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
370 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.848295  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  40.55 
 
 
391 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  40.27 
 
 
369 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  40.93 
 
 
366 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 
356 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  41.26 
 
 
353 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  41.98 
 
 
391 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  41.55 
 
 
357 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
379 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  40.27 
 
 
357 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 
356 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  40.49 
 
 
366 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0525  ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 
371 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143614  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 
356 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  40.63 
 
 
369 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  40.63 
 
 
369 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  45.97 
 
 
368 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  41.26 
 
 
355 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  41.55 
 
 
338 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  46.03 
 
 
369 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  45.97 
 
 
368 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  39.23 
 
 
353 aa  276  3e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  40.58 
 
 
372 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  40.58 
 
 
371 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  40.63 
 
 
369 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  40.16 
 
 
369 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  46.23 
 
 
377 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>