More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2865 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2865  ABC transporter related  100 
 
 
373 aa  757    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  61.73 
 
 
373 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  53.62 
 
 
377 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  54.84 
 
 
381 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  52.53 
 
 
375 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  50.53 
 
 
379 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  54.05 
 
 
382 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  52.23 
 
 
383 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  52.42 
 
 
379 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  52.65 
 
 
378 aa  359  3e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  50.82 
 
 
380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  54.7 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  52.24 
 
 
379 aa  354  1e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.21 
 
 
368 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.53 
 
 
372 aa  338  8e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1816  ABC transporter related protein  53.6 
 
 
390 aa  337  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  51.62 
 
 
371 aa  335  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.06 
 
 
366 aa  330  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  50.69 
 
 
356 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.28 
 
 
376 aa  328  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  51.25 
 
 
364 aa  328  7e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.06 
 
 
367 aa  328  7e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.66 
 
 
367 aa  328  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.28 
 
 
367 aa  328  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  49.18 
 
 
374 aa  328  8e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  49.2 
 
 
375 aa  328  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  49.19 
 
 
365 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  51.75 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.25 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  48.92 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.6 
 
 
361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  51.82 
 
 
367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  48.94 
 
 
353 aa  326  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  48.91 
 
 
358 aa  325  7e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  47.44 
 
 
371 aa  325  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  52.84 
 
 
370 aa  323  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  46.83 
 
 
370 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  48.66 
 
 
370 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  50.96 
 
 
360 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.79 
 
 
367 aa  323  4e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  49.58 
 
 
356 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.79 
 
 
367 aa  323  4e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.08 
 
 
379 aa  322  9.000000000000001e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  50.43 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  46.06 
 
 
409 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5468  ABC transporter related  46.24 
 
 
336 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.59 
 
 
352 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
369 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  49.18 
 
 
366 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.52 
 
 
369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.92 
 
 
369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  48.34 
 
 
353 aa  319  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  48.04 
 
 
374 aa  319  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  47.8 
 
 
366 aa  318  7e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
370 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  47.8 
 
 
366 aa  318  7e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  44.16 
 
 
389 aa  318  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  48.99 
 
 
357 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  46.76 
 
 
366 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  45.78 
 
 
366 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  48.64 
 
 
370 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  46.98 
 
 
405 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  46.98 
 
 
405 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  49.72 
 
 
353 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  50 
 
 
378 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  48.54 
 
 
365 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  47.92 
 
 
405 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  44.3 
 
 
381 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 
363 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  48.01 
 
 
368 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49.44 
 
 
426 aa  317  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  47.24 
 
 
357 aa  316  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.22 
 
 
370 aa  316  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  49.6 
 
 
362 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  43.82 
 
 
386 aa  315  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  44.99 
 
 
366 aa  315  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.07 
 
 
366 aa  315  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.98 
 
 
386 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
366 aa  315  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  49.85 
 
 
352 aa  315  9e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.76 
 
 
372 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
364 aa  314  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  45.45 
 
 
363 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  47.06 
 
 
585 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  48.95 
 
 
381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.92 
 
 
366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  47.34 
 
 
388 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  52.06 
 
 
360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.05 
 
 
380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  52.29 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  49.55 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  52.07 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  44.92 
 
 
363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>