More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6367 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  100 
 
 
371 aa  750    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5634  ABC transporter related  82.29 
 
 
367 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21087  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  55.62 
 
 
365 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0703  ABC transporter related  58.26 
 
 
369 aa  411  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.64 
 
 
370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  44.59 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  46.94 
 
 
385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  47.11 
 
 
370 aa  301  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.98 
 
 
367 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  42.42 
 
 
365 aa  297  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.98 
 
 
367 aa  297  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.87 
 
 
369 aa  296  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  46.34 
 
 
368 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  46.34 
 
 
368 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  43.92 
 
 
363 aa  295  8e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  50.16 
 
 
336 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
389 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  43.89 
 
 
359 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  46.49 
 
 
369 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  46.07 
 
 
351 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  52.61 
 
 
377 aa  293  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  47.37 
 
 
332 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  42.23 
 
 
366 aa  292  8e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  44.86 
 
 
338 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  44.63 
 
 
363 aa  290  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  46.05 
 
 
372 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  46.78 
 
 
332 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  44.75 
 
 
358 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  45.23 
 
 
393 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  47.18 
 
 
361 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  44.54 
 
 
333 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  47.66 
 
 
332 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  48.41 
 
 
332 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  45.95 
 
 
369 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  46.78 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  45.68 
 
 
369 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  42.7 
 
 
370 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.67 
 
 
369 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  45.89 
 
 
349 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  46.78 
 
 
332 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  44.41 
 
 
358 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  45.73 
 
 
369 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  50.64 
 
 
380 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  50.64 
 
 
376 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 
335 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  43.5 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  49.68 
 
 
359 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  44.67 
 
 
338 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  43.77 
 
 
372 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.5 
 
 
355 aa  286  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  51.72 
 
 
377 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  44.32 
 
 
403 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  51.57 
 
 
377 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  46.5 
 
 
361 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  43.81 
 
 
391 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  47.69 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  45.48 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  52.26 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  51.85 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  48.3 
 
 
377 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.26 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  47.73 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 
388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  43.75 
 
 
366 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  45.28 
 
 
361 aa  282  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  44.86 
 
 
357 aa  282  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  50.52 
 
 
366 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.5 
 
 
363 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.45 
 
 
386 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  44.51 
 
 
352 aa  282  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 
333 aa  282  8.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  47.59 
 
 
369 aa  282  8.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 
370 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  45.23 
 
 
372 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  47.18 
 
 
333 aa  281  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  46.55 
 
 
334 aa  281  9e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.53 
 
 
366 aa  281  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  49.84 
 
 
367 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.81 
 
 
370 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.5 
 
 
364 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.83 
 
 
366 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  48.4 
 
 
373 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  51.68 
 
 
369 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  42.22 
 
 
381 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.33 
 
 
349 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  43.55 
 
 
333 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 
369 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  45.8 
 
 
332 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.16 
 
 
349 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.55 
 
 
366 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 
333 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 
370 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.19 
 
 
364 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.86 
 
 
366 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  45.58 
 
 
370 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>