More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0633 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  100 
 
 
379 aa  766    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  65.87 
 
 
378 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  64.12 
 
 
379 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  62.88 
 
 
375 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  56.79 
 
 
377 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  54.15 
 
 
373 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  52.3 
 
 
382 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  55.44 
 
 
382 aa  377  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  53.6 
 
 
381 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2865  ABC transporter related  50.53 
 
 
373 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  51.58 
 
 
366 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  51.5 
 
 
364 aa  360  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  50.26 
 
 
383 aa  358  6e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.88 
 
 
370 aa  353  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1816  ABC transporter related protein  54.21 
 
 
390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.47 
 
 
366 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  50 
 
 
379 aa  349  4e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  52.33 
 
 
360 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.79 
 
 
372 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  52.33 
 
 
360 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.73 
 
 
367 aa  346  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.6 
 
 
369 aa  347  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.73 
 
 
367 aa  346  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  50.54 
 
 
381 aa  345  8e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  48.44 
 
 
388 aa  343  4e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  52.04 
 
 
362 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  49.73 
 
 
384 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  47.44 
 
 
385 aa  341  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.12 
 
 
367 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  49.46 
 
 
359 aa  338  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  51.57 
 
 
381 aa  336  5e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  46.72 
 
 
355 aa  335  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
370 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0960  ATPase  46.35 
 
 
417 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.284254  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  48.26 
 
 
365 aa  333  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  47.38 
 
 
395 aa  332  6e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  49.46 
 
 
368 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  46.17 
 
 
355 aa  332  6e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  50.13 
 
 
370 aa  332  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  47.83 
 
 
366 aa  331  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.11 
 
 
358 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.38 
 
 
358 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.54 
 
 
356 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.28 
 
 
357 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.28 
 
 
357 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.54 
 
 
356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  46.88 
 
 
370 aa  329  6e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  47.31 
 
 
380 aa  329  6e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  48.91 
 
 
356 aa  328  9e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.54 
 
 
356 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  49.86 
 
 
360 aa  328  9e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
374 aa  328  9e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  48.1 
 
 
360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.01 
 
 
357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  47.18 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  46.39 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.27 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  48.39 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  47.18 
 
 
367 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 
377 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 
376 aa  327  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  47.2 
 
 
372 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 
366 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  45.64 
 
 
395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  48.25 
 
 
374 aa  326  5e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  46.24 
 
 
386 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  47.99 
 
 
358 aa  325  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  45.72 
 
 
373 aa  325  9e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  45.36 
 
 
402 aa  324  1e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  46.65 
 
 
366 aa  324  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 
356 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.49 
 
 
379 aa  323  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.33 
 
 
386 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  46.44 
 
 
375 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.38 
 
 
351 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  47.26 
 
 
373 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  46.68 
 
 
367 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.08 
 
 
369 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 
366 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  47.87 
 
 
371 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 
359 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.17 
 
 
356 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  46.99 
 
 
384 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  45.97 
 
 
365 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  46.03 
 
 
381 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 
381 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
374 aa  322  5e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.17 
 
 
356 aa  322  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.26 
 
 
367 aa  322  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.28 
 
 
357 aa  322  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.9 
 
 
356 aa  322  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 
366 aa  322  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.6 
 
 
363 aa  322  7e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.76 
 
 
369 aa  322  8e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  48.58 
 
 
364 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  47.43 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.03 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>