More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2430 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  100 
 
 		 365 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  55.62 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5634  ABC transporter related  56.86 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0703  ABC transporter related  53.46 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 386 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 		 386 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  43.65 
 
 		 389 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.38 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  45.1 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  45.71 
 
 		 381 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  46.59 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  43.55 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  44.66 
 
 		 363 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  44.04 
 
 		 403 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  45.9 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  45.9 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  43.37 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  43.37 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  43.09 
 
 		 384 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  44.69 
 
 		 355 aa  298  7e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  43.09 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  45.68 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.14 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  44.7 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  42.74 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  43.09 
 
 		 369 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.86 
 
 		 355 aa  296  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  40.81 
 
 		 366 aa  295  6e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  41.62 
 
 		 365 aa  294  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  45.66 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  45.11 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  42.66 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  45.23 
 
 		 369 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  43.38 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  42.5 
 
 		 375 aa  293  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  45.04 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  43.07 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  44.82 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  44.41 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  44.41 
 
 		 332 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  42.35 
 
 		 385 aa  291  9e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1416  ABC transporter related  44.63 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  43.55 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  44.26 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  44.48 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  45.01 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  43.4 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  45.56 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  43.22 
 
 		 353 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  45.58 
 
 		 359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  43.51 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0844  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 362 aa  289  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  42.93 
 
 		 366 aa  288  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  44 
 
 		 353 aa  288  9e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  43.4 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.01 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.07 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  43.72 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  44.32 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  42.93 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  43.77 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  45.63 
 
 		 357 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3347  ABC transporter related  48.57 
 
 		 343 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  44.07 
 
 		 357 aa  285  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  43.87 
 
 		 367 aa  285  9e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  44.73 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  42.16 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  42.04 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  42.19 
 
 		 369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  45.01 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  44.6 
 
 		 355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  43.43 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  43.96 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  42.59 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  43.63 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  42.55 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  44.23 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  44.19 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  41.44 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  42.16 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  42.16 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  42.16 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 363 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  44.44 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  42.48 
 
 		 381 aa  282  6.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  44.41 
 
 		 332 aa  282  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  42.39 
 
 		 370 aa  281  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 		 370 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  44.16 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  42.7 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  43.63 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  41.24 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  43.1 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  43.21 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  44.13 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  42.98 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  44.35 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  42.13 
 
 		 333 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>