More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5863 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  100 
 
 		 358 aa  728    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  85.47 
 
 		 358 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  45.1 
 
 		 365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2431  ABC transporter related  53.35 
 
 		 342 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0704  ABC transporter related  56.25 
 
 		 336 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  47.45 
 
 		 365 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  43.75 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  43.75 
 
 		 384 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  46.45 
 
 		 374 aa  293  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  43.44 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  46.07 
 
 		 351 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  44.6 
 
 		 365 aa  292  8e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  41.94 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  45.53 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.86 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  46.01 
 
 		 360 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  42.66 
 
 		 386 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  45.35 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  42.35 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  45.79 
 
 		 350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  45.79 
 
 		 350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  45.79 
 
 		 350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  44.41 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.33 
 
 		 363 aa  289  6e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  45.41 
 
 		 369 aa  288  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  44.75 
 
 		 372 aa  288  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6366  ABC transporter related  46.11 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0766362  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  44.41 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  43.75 
 
 		 367 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  43.75 
 
 		 367 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  45.25 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  43.62 
 
 		 391 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  44.84 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5633  ABC transporter related  51.32 
 
 		 345 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 381 aa  283  5.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  44.72 
 
 		 375 aa  282  5.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2865  ABC transporter related  45.05 
 
 		 373 aa  282  6.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4075  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 370 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.848295  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  43.94 
 
 		 356 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  44.32 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  43.56 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  44.78 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 		 353 aa  279  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  44.2 
 
 		 359 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  44.48 
 
 		 359 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5634  ABC transporter related  44.82 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  43.68 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.67 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  40.7 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  44.26 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  42.93 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  41.9 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  46.61 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  44.44 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  43.21 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  41.62 
 
 		 355 aa  275  8e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  43.99 
 
 		 360 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  42.9 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  43.58 
 
 		 355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  44.99 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  43.01 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  42.15 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  45.13 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  42.97 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  44.01 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  46.74 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.13 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  42.78 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  48 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  52.08 
 
 		 360 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  40.65 
 
 		 368 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  42.74 
 
 		 369 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  42.21 
 
 		 364 aa  272  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  42.93 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  47.66 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  41.99 
 
 		 360 aa  271  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 351 aa  271  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  43.01 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  42.86 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  43.4 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  44.17 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  43.96 
 
 		 376 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  42.16 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  42.02 
 
 		 357 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  42.34 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  44.86 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  40.9 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  42.9 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  41.53 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  43.96 
 
 		 380 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  43.06 
 
 		 348 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  44.32 
 
 		 356 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  43.84 
 
 		 371 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>