More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5633 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5633  ABC transporter related  100 
 
 		 345 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6366  ABC transporter related  82.27 
 
 		 339 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0766362  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0704  ABC transporter related  58.02 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2431  ABC transporter related  54.29 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  52.08 
 
 		 358 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  51.32 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  50.34 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  53.15 
 
 		 370 aa  281  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  51.18 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  55.14 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  57.55 
 
 		 403 aa  278  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  52.31 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  48.17 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  54.1 
 
 		 363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  46.38 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  48.47 
 
 		 342 aa  272  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  55.24 
 
 		 369 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  40.79 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  44.09 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  46.55 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  42.7 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0346  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.35 
 
 		 345 aa  269  5e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 		 360 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  52.02 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  52.03 
 
 		 421 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  53.47 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  52.42 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  53.47 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  42.09 
 
 		 352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  47.06 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  41.03 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  46.96 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  50 
 
 		 333 aa  265  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  44.38 
 
 		 372 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  53.47 
 
 		 369 aa  264  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  47.84 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  51.21 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  42.94 
 
 		 371 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  41.81 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  49.03 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 431 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  40.55 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  38.93 
 
 		 366 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4123  ABC transporter related  43.21 
 
 		 367 aa  262  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  53.66 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  42.82 
 
 		 375 aa  262  6e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  43.06 
 
 		 365 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.29 
 
 		 351 aa  262  8e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5634  ABC transporter related  43.92 
 
 		 367 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.12 
 
 		 359 aa  262  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.57 
 
 		 351 aa  261  8.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  50.56 
 
 		 332 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  38.73 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  44.74 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.4 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  51.84 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  49.63 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1103  ABC transporter related  44.38 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  41.23 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.03 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  39.01 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  46.33 
 
 		 409 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  45.64 
 
 		 395 aa  260  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.47 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  53.41 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  50.6 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  52.65 
 
 		 377 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3347  ABC transporter related  52.29 
 
 		 343 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 357 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  42.4 
 
 		 349 aa  258  8e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  44.26 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  38.46 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  40.49 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  42.86 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  51.49 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  42.47 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  45.18 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  54.51 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.11 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  45.01 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.23 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  45.01 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3168  ABC transporter related  41.53 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0198252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5207  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.34 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  50.82 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2491  ABC transporter related protein  43.73 
 
 		 379 aa  256  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  50 
 
 		 367 aa  257  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  48.16 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  37.91 
 
 		 368 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  51.63 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.81 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>