More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4985 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  100 
 
 
369 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  78.32 
 
 
369 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  46.03 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  43.67 
 
 
389 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  46.61 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  46.11 
 
 
364 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 
386 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.48 
 
 
366 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 
386 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  45.41 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  44.89 
 
 
369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.7 
 
 
386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 
356 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  45.84 
 
 
369 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  42.59 
 
 
386 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  45.3 
 
 
375 aa  310  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  45.95 
 
 
369 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  44.92 
 
 
363 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  44.26 
 
 
366 aa  309  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.93 
 
 
356 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  42.51 
 
 
365 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
369 aa  308  8e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  44.68 
 
 
367 aa  308  9e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  44.68 
 
 
367 aa  308  9e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.93 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  42.2 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 
366 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 
366 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 
366 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 
366 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 
366 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 
366 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 
363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.51 
 
 
356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.51 
 
 
356 aa  305  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.51 
 
 
356 aa  305  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.93 
 
 
356 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  43.67 
 
 
360 aa  305  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  44.51 
 
 
356 aa  305  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  44.51 
 
 
356 aa  305  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.38 
 
 
356 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  44.2 
 
 
378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  45.55 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  46.47 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  45.9 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  45.21 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  42.36 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  43.51 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  43.78 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  42.32 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.81 
 
 
357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  45.38 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.21 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
356 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  44.32 
 
 
364 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  44.41 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  45.41 
 
 
365 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  46.2 
 
 
360 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.53 
 
 
356 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  46.74 
 
 
362 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4866  ABC transporter related  42.74 
 
 
365 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.112341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  43.84 
 
 
366 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  42.62 
 
 
384 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.96 
 
 
356 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  47.18 
 
 
374 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  42.19 
 
 
365 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.13 
 
 
360 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  44.62 
 
 
384 aa  299  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  42.09 
 
 
367 aa  299  5e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  42.55 
 
 
384 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  43.56 
 
 
366 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.13 
 
 
360 aa  298  7e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  44.26 
 
 
370 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  43.17 
 
 
353 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2287  ABC transporter related  43.72 
 
 
362 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  52.72 
 
 
393 aa  298  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.77 
 
 
378 aa  298  9e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  42.82 
 
 
384 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  45.86 
 
 
360 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  45.86 
 
 
360 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  45.86 
 
 
360 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  45.88 
 
 
356 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  43.34 
 
 
377 aa  298  1e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.86 
 
 
360 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.68 
 
 
369 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
377 aa  297  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  41.92 
 
 
355 aa  297  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  42.93 
 
 
381 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  45.23 
 
 
353 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
380 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
370 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.86 
 
 
360 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  42.08 
 
 
367 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  43.84 
 
 
351 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>