More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2431 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2431  ABC transporter related  100 
 
 		 342 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6366  ABC transporter related  54.52 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0766362  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0704  ABC transporter related  53.89 
 
 		 336 aa  345  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5633  ABC transporter related  54.29 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  59.38 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  53.35 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  44.72 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  45.08 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  58.54 
 
 		 363 aa  294  1e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  43.86 
 
 		 338 aa  291  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  46.74 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  48.04 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  47.15 
 
 		 332 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  47.15 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  56.52 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  57.66 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  45.54 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  45.92 
 
 		 332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  55.92 
 
 		 358 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.77 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  45.67 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  46.73 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.77 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  45.48 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  45.35 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  46.71 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  56.38 
 
 		 369 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  51.81 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  47.81 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  43.82 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  47.8 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  43.82 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 351 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  43.82 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  47.47 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  43.85 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.54 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  46.13 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  48.49 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  44.05 
 
 		 360 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 393 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  45.48 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  42.61 
 
 		 364 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  55.95 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 		 373 aa  275  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  54.44 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5207  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.4 
 
 		 348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  42.54 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  45.05 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  53.97 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3347  ABC transporter related  47.3 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  53.97 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  43.06 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  45.89 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  45.05 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  45.85 
 
 		 357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  46.71 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  45.82 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  41.9 
 
 		 352 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  43.21 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  43.53 
 
 		 363 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  47 
 
 		 332 aa  271  9e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 377 aa  271  9e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  44.83 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  52.63 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.43 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2491  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  42.14 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.48 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  52.99 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  55.1 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  42.9 
 
 		 361 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.99 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  43.31 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.84 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  50.18 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  42.82 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  52.99 
 
 		 352 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  52.38 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  47.78 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  45.57 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.25 
 
 		 369 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6262  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.84 
 
 		 344 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.543134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  50.4 
 
 		 376 aa  269  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  43.77 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  43.77 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  49.47 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  44.25 
 
 		 334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  47.25 
 
 		 333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  47.47 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 389 aa  268  7e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  43.77 
 
 		 348 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  42.33 
 
 		 360 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  43.35 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  44.51 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  45.4 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>