More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6366 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6366  ABC transporter related  100 
 
 
339 aa  675    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0766362  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5633  ABC transporter related  82.27 
 
 
345 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20666  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0704  ABC transporter related  58.41 
 
 
336 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433646  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2431  ABC transporter related  54.52 
 
 
342 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  52.94 
 
 
358 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  56.45 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  46.11 
 
 
358 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  53.54 
 
 
370 aa  285  8e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  41.64 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  45.88 
 
 
371 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  45.7 
 
 
344 aa  278  9e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  54.92 
 
 
358 aa  276  4e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  55.28 
 
 
363 aa  276  5e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  56.91 
 
 
403 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  46.24 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  43.75 
 
 
338 aa  272  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  48.65 
 
 
365 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  43.38 
 
 
371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  43.23 
 
 
352 aa  269  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1103  ABC transporter related  44.29 
 
 
357 aa  269  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  52.65 
 
 
377 aa  269  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  44.72 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  51.54 
 
 
418 aa  268  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  42.15 
 
 
365 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  56.91 
 
 
415 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  53.44 
 
 
367 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  50.75 
 
 
332 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  53.44 
 
 
367 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  53.63 
 
 
369 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  42.82 
 
 
369 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5634  ABC transporter related  44.85 
 
 
367 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21087  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  48.14 
 
 
377 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  39.89 
 
 
368 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  42.62 
 
 
366 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  51.11 
 
 
332 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  43.02 
 
 
377 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  54.69 
 
 
369 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  52.82 
 
 
377 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  51.11 
 
 
332 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  43.18 
 
 
351 aa  263  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  40.61 
 
 
360 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  48.26 
 
 
353 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  43.03 
 
 
331 aa  262  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  54.62 
 
 
375 aa  262  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  43.06 
 
 
359 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  51.64 
 
 
355 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 
393 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  45.59 
 
 
341 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  50.2 
 
 
421 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  49.48 
 
 
416 aa  260  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  53.01 
 
 
372 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  43.58 
 
 
332 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.55 
 
 
359 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.11 
 
 
360 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  50.8 
 
 
366 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  50.2 
 
 
366 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
395 aa  259  4e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  45.07 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  50.19 
 
 
342 aa  258  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  52.24 
 
 
377 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  40.62 
 
 
366 aa  258  8e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  42.9 
 
 
361 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.82 
 
 
370 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
431 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.61 
 
 
366 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  43.18 
 
 
361 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2491  ABC transporter related protein  41.08 
 
 
379 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  38.54 
 
 
366 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
374 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  44.57 
 
 
362 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  52.61 
 
 
370 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
379 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  48.59 
 
 
365 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  48.59 
 
 
365 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.45 
 
 
333 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  47.45 
 
 
332 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0346  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.83 
 
 
345 aa  256  3e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  51.42 
 
 
367 aa  256  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  41.94 
 
 
359 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3347  ABC transporter related  52.67 
 
 
343 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  43.45 
 
 
332 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1314  ABC transporter related  53.01 
 
 
373 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  51.02 
 
 
377 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  51.74 
 
 
365 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  43.27 
 
 
360 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  39.67 
 
 
369 aa  255  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  38.87 
 
 
368 aa  255  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  38.87 
 
 
368 aa  255  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  42.42 
 
 
356 aa  255  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 
335 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.33 
 
 
372 aa  255  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  48.01 
 
 
366 aa  255  7e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.81 
 
 
357 aa  255  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  39.39 
 
 
370 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  52.85 
 
 
375 aa  255  8e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  45.06 
 
 
348 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  51.43 
 
 
356 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  45.06 
 
 
348 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  47 
 
 
357 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  51.64 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>