More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1314 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1314  ABC transporter related  100 
 
 
373 aa  743    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  65.04 
 
 
372 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  65.04 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  53.93 
 
 
367 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  53.93 
 
 
367 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  51.23 
 
 
366 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 
366 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 
366 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.23 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  52.19 
 
 
366 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.57 
 
 
370 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  54.27 
 
 
372 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  51.22 
 
 
367 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  54.11 
 
 
376 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 
366 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  52.96 
 
 
374 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  52.59 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  50.95 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.48 
 
 
370 aa  357  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  51.09 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  55.07 
 
 
374 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  51.9 
 
 
380 aa  355  5e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  51.21 
 
 
372 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  51.22 
 
 
369 aa  355  8.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  51.36 
 
 
370 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.21 
 
 
368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  52.5 
 
 
381 aa  350  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.04 
 
 
369 aa  349  4e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.9 
 
 
367 aa  349  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  53.19 
 
 
360 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
364 aa  349  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  49.05 
 
 
364 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  51.09 
 
 
367 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  53.31 
 
 
360 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  47.28 
 
 
365 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
364 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  47.5 
 
 
363 aa  347  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  48.2 
 
 
365 aa  346  4e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  48.2 
 
 
365 aa  346  4e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  52.42 
 
 
365 aa  346  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.59 
 
 
370 aa  345  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  49.05 
 
 
364 aa  345  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.53 
 
 
372 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
364 aa  344  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  49.05 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  51.65 
 
 
353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  52.5 
 
 
364 aa  342  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  49.18 
 
 
366 aa  340  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  49.18 
 
 
366 aa  340  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  50.41 
 
 
364 aa  341  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  50 
 
 
352 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  52.35 
 
 
359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  51.49 
 
 
369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  48.23 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
371 aa  339  4e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  52.32 
 
 
353 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  48.48 
 
 
367 aa  338  8e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  51.89 
 
 
369 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  48.2 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.8 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  53.57 
 
 
362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.95 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0057  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.6 
 
 
363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  54.01 
 
 
410 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  48.1 
 
 
385 aa  335  7e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  48.52 
 
 
383 aa  335  7e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.06 
 
 
366 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
377 aa  334  2e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 
360 aa  333  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  51.06 
 
 
382 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  48.53 
 
 
363 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  49.04 
 
 
366 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0525  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
371 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 
360 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.48 
 
 
367 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  51.46 
 
 
375 aa  333  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
360 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  51.06 
 
 
382 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.94 
 
 
369 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  50.81 
 
 
384 aa  332  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.4 
 
 
359 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  48.9 
 
 
391 aa  332  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  49.05 
 
 
368 aa  332  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  49.73 
 
 
360 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 
372 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  51.82 
 
 
352 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.1 
 
 
364 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.7 
 
 
402 aa  331  1e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  50 
 
 
363 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  49.73 
 
 
360 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  46.4 
 
 
371 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  49.73 
 
 
360 aa  331  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.68 
 
 
352 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>