More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1149 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  100 
 
 
358 aa  714    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  55.94 
 
 
363 aa  340  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  50.85 
 
 
354 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.14 
 
 
367 aa  333  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.14 
 
 
367 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  57.1 
 
 
357 aa  332  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  50.28 
 
 
355 aa  332  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50.72 
 
 
353 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.23 
 
 
370 aa  329  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  49.7 
 
 
352 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.11 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  50.73 
 
 
355 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  52.96 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  52.63 
 
 
368 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 
368 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  49.56 
 
 
353 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  50.95 
 
 
370 aa  323  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  49.11 
 
 
353 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  50.91 
 
 
366 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  48.79 
 
 
372 aa  322  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.28 
 
 
364 aa  322  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  52.82 
 
 
363 aa  322  7e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  49.18 
 
 
370 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  49.42 
 
 
361 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.7 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  54.67 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.58 
 
 
349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  46.88 
 
 
345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.06 
 
 
369 aa  319  5e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  56.14 
 
 
364 aa  318  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  54.83 
 
 
364 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  51.62 
 
 
358 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  47.59 
 
 
340 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  51.08 
 
 
375 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.57 
 
 
366 aa  317  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  54.84 
 
 
353 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  46.99 
 
 
354 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  46.88 
 
 
355 aa  315  8e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  52.63 
 
 
360 aa  315  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  48.73 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  48.57 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  47.71 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  51.27 
 
 
369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  54.87 
 
 
368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  48.23 
 
 
372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 
366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  49.86 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.17 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  46.47 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  49.72 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  46.78 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  53.55 
 
 
356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  49.44 
 
 
363 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.17 
 
 
364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 
366 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  52.32 
 
 
360 aa  312  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  53.4 
 
 
357 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.55 
 
 
351 aa  312  5.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  46.91 
 
 
367 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  52.87 
 
 
369 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  54.36 
 
 
426 aa  312  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 
376 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  46.91 
 
 
367 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  47.63 
 
 
365 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
365 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 
376 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  51.63 
 
 
373 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  48.48 
 
 
360 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  48.2 
 
 
360 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 
365 aa  311  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
365 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  47.34 
 
 
356 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.91 
 
 
376 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.73 
 
 
349 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  48.08 
 
 
366 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  50.78 
 
 
369 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1416  ABC transporter related  48.85 
 
 
347 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10901  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  48.03 
 
 
355 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.9 
 
 
366 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
366 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
366 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.9 
 
 
366 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
366 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  50.95 
 
 
369 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  48.31 
 
 
385 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  51.43 
 
 
368 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  52.87 
 
 
369 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  51.43 
 
 
368 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  48.19 
 
 
338 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  46.63 
 
 
361 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  46.7 
 
 
371 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.74 
 
 
381 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.27 
 
 
349 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  53.4 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  51.71 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  51.55 
 
 
370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  47.13 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  46.17 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  51.27 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>