More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1852 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  100 
 
 
395 aa  801    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  77.47 
 
 
395 aa  623  1e-177  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2267  ABC transporter related  70.89 
 
 
393 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274393  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2486  ABC transporter related  65.61 
 
 
375 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.948028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.33 
 
 
370 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.45 
 
 
367 aa  360  3e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.45 
 
 
367 aa  360  3e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.72 
 
 
368 aa  359  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  47 
 
 
384 aa  359  6e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.67 
 
 
372 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  46.72 
 
 
367 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.41 
 
 
372 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  48.57 
 
 
370 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  47.66 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48 
 
 
370 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  51.58 
 
 
366 aa  351  1e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.77 
 
 
369 aa  351  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  45.41 
 
 
367 aa  351  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  45.87 
 
 
426 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
364 aa  349  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.16 
 
 
369 aa  348  7e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  44.88 
 
 
367 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  47.69 
 
 
370 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  45.93 
 
 
367 aa  346  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 
369 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  48.56 
 
 
381 aa  345  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  46.11 
 
 
370 aa  344  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  46.19 
 
 
381 aa  342  5.999999999999999e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  46.93 
 
 
370 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  45.57 
 
 
371 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
380 aa  339  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  46.25 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  47.89 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  47.09 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  47.89 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  46.37 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  46.39 
 
 
389 aa  336  5e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  46.92 
 
 
374 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
379 aa  335  7.999999999999999e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
381 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  44.88 
 
 
366 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  46.97 
 
 
354 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  46.17 
 
 
366 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  45.93 
 
 
379 aa  331  1e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  45.68 
 
 
353 aa  330  2e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  46.37 
 
 
399 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
366 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
366 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  46.65 
 
 
366 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
364 aa  330  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  44.53 
 
 
363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
377 aa  329  6e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  45.39 
 
 
405 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.55 
 
 
360 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.32 
 
 
366 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 
366 aa  328  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 
366 aa  328  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 
366 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.32 
 
 
366 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  44.71 
 
 
367 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 
366 aa  328  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.97 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  45.97 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  45.99 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  45.95 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  44.44 
 
 
367 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  44.44 
 
 
367 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  45.64 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  45.71 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
364 aa  326  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
363 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  47.16 
 
 
382 aa  325  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  46.37 
 
 
402 aa  325  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 
366 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  46.84 
 
 
364 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  46.7 
 
 
360 aa  324  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.23 
 
 
406 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  45.57 
 
 
409 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  43.08 
 
 
355 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.08 
 
 
355 aa  323  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  47.88 
 
 
374 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  45.88 
 
 
378 aa  323  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  44.33 
 
 
366 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  44.33 
 
 
366 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  45.62 
 
 
362 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  46.37 
 
 
421 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  46.89 
 
 
352 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  44.62 
 
 
358 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  43.98 
 
 
365 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
379 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  45.28 
 
 
359 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  46.58 
 
 
383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  45.84 
 
 
358 aa  320  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  44.91 
 
 
382 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  45.65 
 
 
360 aa  319  6e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  43.92 
 
 
371 aa  318  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  44.91 
 
 
361 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>