More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0703 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0703  ABC transporter related  100 
 
 
369 aa  746    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  58.26 
 
 
371 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5634  ABC transporter related  60.22 
 
 
367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21087  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  53.46 
 
 
365 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  44.84 
 
 
367 aa  296  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  44.84 
 
 
367 aa  296  5e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  45.89 
 
 
364 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.58 
 
 
363 aa  293  4e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  45.48 
 
 
380 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  45.51 
 
 
372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  45.63 
 
 
366 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  45.25 
 
 
357 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  44.74 
 
 
381 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  41.08 
 
 
370 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.93 
 
 
369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  43.7 
 
 
372 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  44.29 
 
 
338 aa  285  8e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 
381 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  44.17 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  45.21 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  44.57 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.72 
 
 
369 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  45.08 
 
 
370 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  43.56 
 
 
374 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  40.66 
 
 
366 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  46.3 
 
 
369 aa  281  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  46.46 
 
 
361 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  43.51 
 
 
370 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  47.03 
 
 
361 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 
359 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  42.47 
 
 
372 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  41.21 
 
 
365 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  45.04 
 
 
359 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  43.1 
 
 
353 aa  278  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  43.68 
 
 
373 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.92 
 
 
349 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.03 
 
 
349 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  43.7 
 
 
366 aa  277  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  43.8 
 
 
365 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  42.31 
 
 
367 aa  276  3e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  42.82 
 
 
359 aa  276  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  44.57 
 
 
356 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2287  ABC transporter related  43.18 
 
 
362 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  44.9 
 
 
363 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  44.02 
 
 
367 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5207  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.7 
 
 
348 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.575313 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  43.94 
 
 
365 aa  275  6e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  43.02 
 
 
349 aa  275  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  44.38 
 
 
362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  43.26 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.1 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  42.7 
 
 
369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  44.66 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  43.6 
 
 
366 aa  274  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 
363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.54 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  43.36 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  44.19 
 
 
355 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49.5 
 
 
426 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  43.48 
 
 
367 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  46.26 
 
 
361 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  44.29 
 
 
356 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  41.47 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  45.43 
 
 
353 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  41.41 
 
 
384 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
369 aa  272  7e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  41.83 
 
 
369 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  46.13 
 
 
368 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  42.7 
 
 
370 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  45.04 
 
 
353 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  42.08 
 
 
365 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  41.76 
 
 
366 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  44.18 
 
 
368 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  42.12 
 
 
364 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  44.76 
 
 
353 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  43.68 
 
 
403 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  43.25 
 
 
360 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  43.79 
 
 
375 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  42.78 
 
 
381 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  44.85 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  44.51 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  46.82 
 
 
361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  45.48 
 
 
349 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  48.33 
 
 
359 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.06 
 
 
364 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  43.26 
 
 
336 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  49.15 
 
 
354 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  43.79 
 
 
361 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.37 
 
 
386 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  41.15 
 
 
384 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  45.25 
 
 
352 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  42.78 
 
 
356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  47.24 
 
 
357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  45.11 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  43.43 
 
 
355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  40.27 
 
 
369 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  46.07 
 
 
368 aa  269  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  43.78 
 
 
402 aa  268  8e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>