More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0844 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0844  ABC transporter related protein  100 
 
 		 362 aa  746    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  95.58 
 
 		 362 aa  712    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3269  ABC transporter related  66.48 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3385  ABC transporter related  64.74 
 
 		 361 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.16 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  47.68 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.23 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  51.98 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  50.31 
 
 		 366 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  48.88 
 
 		 375 aa  328  7e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  51.18 
 
 		 378 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  48.9 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  47.83 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  46.89 
 
 		 372 aa  326  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  49.86 
 
 		 363 aa  326  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 		 364 aa  325  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  52.72 
 
 		 355 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  50 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  47.2 
 
 		 379 aa  323  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 375 aa  323  2e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.68 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.68 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.32 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.68 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  45.4 
 
 		 356 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  45.4 
 
 		 356 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  47.67 
 
 		 363 aa  322  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  48.1 
 
 		 359 aa  322  5e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.68 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 356 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.68 
 
 		 356 aa  322  9.000000000000001e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.96 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  46.59 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  48.37 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 		 356 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  49.18 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  50.69 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5438  ABC transporter related protein  51.9 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  46.03 
 
 		 367 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.29 
 
 		 332 aa  318  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  48.48 
 
 		 360 aa  318  7e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 		 356 aa  318  7e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  46.68 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.09 
 
 		 349 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  45.92 
 
 		 367 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.9 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  48.01 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  46.85 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  45.66 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  48.74 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  46.92 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  50.16 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  47.3 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  48.01 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  46.69 
 
 		 367 aa  316  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 365 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  47.35 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  51.14 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  46.69 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.07 
 
 		 358 aa  316  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.79 
 
 		 357 aa  316  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  51.9 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  50.45 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  47.41 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  54.2 
 
 		 355 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  48.73 
 
 		 352 aa  316  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  50.49 
 
 		 360 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.6 
 
 		 426 aa  315  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  46.41 
 
 		 352 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 361 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  49.84 
 
 		 361 aa  315  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.24 
 
 		 361 aa  315  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 370 aa  315  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  47.51 
 
 		 355 aa  315  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  50 
 
 		 361 aa  315  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  47.99 
 
 		 364 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 369 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.06 
 
 		 376 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  53.95 
 
 		 355 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  50.46 
 
 		 410 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  45.51 
 
 		 353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  44.17 
 
 		 369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  47.78 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>