More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3269 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3269  ABC transporter related  100 
 
 
361 aa  748    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3385  ABC transporter related  79.72 
 
 
361 aa  587  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0844  ABC transporter related protein  66.48 
 
 
362 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0630  ABC transporter related  65.75 
 
 
362 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  46.24 
 
 
363 aa  336  5e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  46.85 
 
 
367 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  47.01 
 
 
368 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  48.34 
 
 
375 aa  331  1e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  47.14 
 
 
367 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  47.3 
 
 
364 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  46.67 
 
 
356 aa  329  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 
375 aa  329  4e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.45 
 
 
365 aa  329  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.94 
 
 
356 aa  329  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  46.67 
 
 
356 aa  329  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  48.5 
 
 
426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
356 aa  329  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
356 aa  329  6e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
356 aa  328  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50.47 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  48.56 
 
 
366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  46.72 
 
 
362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  47.34 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  45.53 
 
 
370 aa  326  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  46.39 
 
 
356 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.2 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.61 
 
 
349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50.42 
 
 
353 aa  326  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.94 
 
 
356 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.11 
 
 
356 aa  325  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.94 
 
 
356 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 
386 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  45.08 
 
 
389 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.94 
 
 
356 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  47.37 
 
 
354 aa  325  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.89 
 
 
351 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  46.89 
 
 
380 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  46.32 
 
 
367 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.78 
 
 
357 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.78 
 
 
357 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  46.05 
 
 
363 aa  323  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  45.87 
 
 
380 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
370 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  47.15 
 
 
370 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.69 
 
 
366 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  46.47 
 
 
360 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
356 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  46.03 
 
 
367 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.34 
 
 
357 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  45.26 
 
 
366 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
393 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.39 
 
 
356 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 
366 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  44.99 
 
 
369 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  47.49 
 
 
377 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.5 
 
 
357 aa  323  4e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 
366 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  45.28 
 
 
365 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.51 
 
 
358 aa  322  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.39 
 
 
356 aa  322  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  45.26 
 
 
369 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  45.81 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  46.49 
 
 
364 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  52.29 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  52.58 
 
 
368 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.58 
 
 
368 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  45.16 
 
 
379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  45.4 
 
 
374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  44.3 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  44.3 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  46.94 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  44.3 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  45.16 
 
 
384 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 
366 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  53.18 
 
 
372 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  45.6 
 
 
370 aa  320  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  45.88 
 
 
364 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 
377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  48.54 
 
 
356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  45.36 
 
 
386 aa  319  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.85 
 
 
364 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  47.65 
 
 
389 aa  319  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.32 
 
 
351 aa  319  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  47.69 
 
 
367 aa  318  6e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  44.15 
 
 
372 aa  318  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  44.57 
 
 
371 aa  319  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  47.69 
 
 
367 aa  318  6e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
366 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  47.92 
 
 
359 aa  318  7e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  49.38 
 
 
366 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  46.45 
 
 
370 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  44.47 
 
 
393 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  47.26 
 
 
359 aa  318  9e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>