More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2068 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  100 
 
 		 364 aa  720    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  50.68 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  50 
 
 		 356 aa  346  5e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  46.54 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  46.26 
 
 		 355 aa  342  4e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6133  ABC transporter related  49.3 
 
 		 351 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269314  normal  0.315029 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  49.3 
 
 		 351 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  47.71 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.58 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.21 
 
 		 370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  45.6 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  42.62 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  46.35 
 
 		 366 aa  319  6e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  45.9 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  46.2 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  45.13 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  47.65 
 
 		 366 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  45.08 
 
 		 378 aa  315  8e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  43.18 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  45.6 
 
 		 379 aa  314  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  48.46 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  46.37 
 
 		 352 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  43.87 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  46.07 
 
 		 382 aa  312  5.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  43.87 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  44.72 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  43.97 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.73 
 
 		 366 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  45.8 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  45.45 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  45.92 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  42.97 
 
 		 379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  46.36 
 
 		 403 aa  308  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  45.38 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  43.49 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  46.07 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  44.41 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  46.13 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  44.63 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  46.63 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  43.91 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  43.49 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  47.73 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2486  ABC transporter related  42.82 
 
 		 375 aa  305  7e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.948028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2287  ABC transporter related  44.75 
 
 		 362 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  43.05 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  45.25 
 
 		 367 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  43.12 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  45.51 
 
 		 353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  44.13 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  45.26 
 
 		 375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  44.54 
 
 		 353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  46.2 
 
 		 380 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  44.19 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  46.45 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  43.77 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  44.92 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  46.13 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  43.82 
 
 		 335 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  46.01 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  45.6 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  42.16 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  43.01 
 
 		 377 aa  302  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.97 
 
 		 362 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  44.36 
 
 		 396 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  45.36 
 
 		 357 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  41.82 
 
 		 375 aa  302  7.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  47.11 
 
 		 360 aa  301  9e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  46.05 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  44.54 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  44.56 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  46.37 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  46.05 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  45.03 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.39 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  44.38 
 
 		 363 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  45.5 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  47.67 
 
 		 358 aa  301  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  43.75 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  46.3 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  46.56 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  44.41 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  45.63 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  43.98 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  44.94 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  45.35 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 355 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.97 
 
 		 362 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  45.51 
 
 		 366 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  44.69 
 
 		 381 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  45.87 
 
 		 361 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 		 369 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>