More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0510 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0510  ATPase  100 
 
 
392 aa  796    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136787  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1825  ATPase  72.38 
 
 
397 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03901  ABC transporter ATP-binding protein  70.66 
 
 
415 aa  564  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0960  ATPase  52.39 
 
 
417 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.284254  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3535  ABC transporter related  49.88 
 
 
431 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.31502  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2050  ABC transporter-like  45.92 
 
 
439 aa  362  8e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2280  ABC transporter related  48.69 
 
 
413 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2331  ABC transporter related  48.43 
 
 
413 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.884473  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3139  ABC transporter-like protein protein  47.29 
 
 
427 aa  352  5.9999999999999994e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  48.14 
 
 
371 aa  332  5e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  46.77 
 
 
366 aa  323  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  44.99 
 
 
361 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  44.27 
 
 
361 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 
373 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  44.92 
 
 
364 aa  316  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  46.07 
 
 
374 aa  316  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  44.05 
 
 
367 aa  315  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  46.19 
 
 
364 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.14 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0231  ABC transporter related  44.47 
 
 
363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.280397  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  44.33 
 
 
381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  43.62 
 
 
365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  45.04 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  43.37 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
368 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  42.79 
 
 
366 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  51.54 
 
 
357 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  43.15 
 
 
368 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.32 
 
 
357 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  43.65 
 
 
372 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  46.58 
 
 
375 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 
375 aa  310  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  46.51 
 
 
360 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 
349 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  43.96 
 
 
360 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 
369 aa  309  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  42.17 
 
 
362 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  45.55 
 
 
359 aa  308  9e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.89 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  42.72 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  45.18 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  40.64 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
364 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  43.77 
 
 
363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  45.5 
 
 
355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  47.44 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1944  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  45.41 
 
 
356 aa  306  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
364 aa  306  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  45.11 
 
 
360 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  45.5 
 
 
355 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  44.85 
 
 
364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  44.56 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  43 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.54 
 
 
369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  43.7 
 
 
366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  42.07 
 
 
380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.65 
 
 
363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  43.72 
 
 
370 aa  306  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  43.15 
 
 
359 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
369 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.42 
 
 
365 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
369 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  41.54 
 
 
363 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  41.33 
 
 
366 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
369 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.26 
 
 
349 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  42.89 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  42.89 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.89 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.89 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  42.11 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  42.89 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.89 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  43.3 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.89 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 
371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  44.61 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.89 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  44.95 
 
 
368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  47.46 
 
 
406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  41.35 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  42.46 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  43 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  44.72 
 
 
357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  42 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  43.4 
 
 
359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
366 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.46 
 
 
366 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 
366 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 
366 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 
366 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.46 
 
 
366 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  44.16 
 
 
333 aa  303  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  50.31 
 
 
357 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  44.72 
 
 
378 aa  303  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>