More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0960 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0960  ATPase  100 
 
 
417 aa  850    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.284254  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2050  ABC transporter-like  58.76 
 
 
439 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3139  ABC transporter-like protein protein  57.31 
 
 
427 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2280  ABC transporter related  56.37 
 
 
413 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3535  ABC transporter related  58.04 
 
 
431 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.31502  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2331  ABC transporter related  56.13 
 
 
413 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.884473  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03901  ABC transporter ATP-binding protein  54.91 
 
 
415 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1825  ATPase  51.89 
 
 
397 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0510  ATPase  52.39 
 
 
392 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136787  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  49.87 
 
 
364 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  50.92 
 
 
357 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.23 
 
 
369 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  46.73 
 
 
366 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  47.76 
 
 
368 aa  339  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  46.6 
 
 
370 aa  339  5e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  46.63 
 
 
363 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  48.37 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  49.86 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.66 
 
 
367 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  50.13 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  48.21 
 
 
352 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  50.13 
 
 
360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  48.54 
 
 
365 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  50.13 
 
 
362 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  45.56 
 
 
409 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  46.35 
 
 
379 aa  333  3e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.05 
 
 
349 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  47.47 
 
 
360 aa  333  5e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.92 
 
 
365 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  48.28 
 
 
353 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.92 
 
 
365 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  48.09 
 
 
363 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  47.56 
 
 
375 aa  332  9e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  48.08 
 
 
360 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  47.38 
 
 
380 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  47.13 
 
 
367 aa  329  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  46.35 
 
 
364 aa  329  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.65 
 
 
365 aa  328  9e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  47.26 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  50.27 
 
 
363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  46.63 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  45.45 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  47.48 
 
 
379 aa  326  5e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  44.67 
 
 
364 aa  325  6e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  47.49 
 
 
358 aa  325  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
364 aa  325  7e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  45.89 
 
 
367 aa  325  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  44.86 
 
 
406 aa  325  9e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.51 
 
 
376 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  46.5 
 
 
375 aa  325  1e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  45.94 
 
 
385 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
374 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  48.61 
 
 
359 aa  324  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.89 
 
 
369 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  47.49 
 
 
370 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  46.53 
 
 
362 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.9 
 
 
361 aa  323  4e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  48.22 
 
 
366 aa  323  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  45.89 
 
 
369 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  44.22 
 
 
364 aa  323  4e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  44.11 
 
 
366 aa  323  5e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  46.35 
 
 
402 aa  322  5e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 
375 aa  322  6e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  50.67 
 
 
363 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  47.85 
 
 
366 aa  322  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  45.11 
 
 
365 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.07 
 
 
351 aa  322  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  48.13 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  45.95 
 
 
366 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  49.06 
 
 
370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  47.73 
 
 
352 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  45.94 
 
 
357 aa  319  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  46.77 
 
 
362 aa  319  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  43.78 
 
 
372 aa  318  7.999999999999999e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  44.56 
 
 
381 aa  318  9e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
378 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  47.1 
 
 
408 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  45.89 
 
 
382 aa  317  2e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
381 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  45.34 
 
 
384 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  45.38 
 
 
355 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.67 
 
 
349 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  46.25 
 
 
362 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.95 
 
 
349 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  46.55 
 
 
353 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 
373 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  43.93 
 
 
398 aa  316  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  47.87 
 
 
356 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  45 
 
 
366 aa  316  5e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.29 
 
 
359 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  45 
 
 
366 aa  316  5e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.17 
 
 
353 aa  316  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2574  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
370 aa  315  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434572  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.52 
 
 
357 aa  315  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  46.44 
 
 
383 aa  315  7e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  47.7 
 
 
356 aa  315  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  44.78 
 
 
370 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  45.29 
 
 
359 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>