More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1825 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1825  ATPase  100 
 
 		 397 aa  805    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03901  ABC transporter ATP-binding protein  73.86 
 
 		 415 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0510  ATPase  72.38 
 
 		 392 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136787  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0960  ATPase  51.89 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.284254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2050  ABC transporter-like  47.25 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3535  ABC transporter related  48.61 
 
 		 431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.31502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3139  ABC transporter-like protein protein  46.79 
 
 		 427 aa  355  8.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2331  ABC transporter related  47.37 
 
 		 413 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.884473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2280  ABC transporter related  47.37 
 
 		 413 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  47.29 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  48.45 
 
 		 371 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  45.32 
 
 		 366 aa  315  9.999999999999999e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1944  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 356 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 364 aa  310  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.68 
 
 		 349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  44 
 
 		 375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  45.22 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.42 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0430  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  46.02 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  49.86 
 
 		 374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 		 375 aa  305  9.000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  45.07 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  49.42 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  45.69 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  41.86 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.64 
 
 		 357 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  47.03 
 
 		 360 aa  302  6.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  47.71 
 
 		 375 aa  302  7.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  46.26 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  46.31 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  50.57 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 381 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  50.57 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.94 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  43.29 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  48.92 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  44.56 
 
 		 355 aa  299  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  43.73 
 
 		 386 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.07 
 
 		 351 aa  299  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 370 aa  299  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.32 
 
 		 351 aa  298  8e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 356 aa  298  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  45.6 
 
 		 357 aa  298  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  45.85 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 363 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.84 
 
 		 364 aa  297  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  45.34 
 
 		 364 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  43.04 
 
 		 362 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  44.22 
 
 		 363 aa  296  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  46.61 
 
 		 363 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  41.9 
 
 		 369 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  45.27 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  43.96 
 
 		 355 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  44.47 
 
 		 355 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.38 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.65 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  44.7 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  47.47 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  45.27 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  42.86 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  40.88 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  41.54 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.64 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  41.65 
 
 		 369 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  45.59 
 
 		 368 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  46.91 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  45.75 
 
 		 360 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.94 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  43.08 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  42.08 
 
 		 356 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  42.08 
 
 		 356 aa  292  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  44.99 
 
 		 364 aa  293  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  41.41 
 
 		 366 aa  292  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  44.82 
 
 		 353 aa  292  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  44.82 
 
 		 359 aa  292  8e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  44.5 
 
 		 360 aa  292  8e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  45.88 
 
 		 384 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 356 aa  292  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 356 aa  292  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  41.13 
 
 		 379 aa  292  9e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.52 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0375  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445668  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  43.83 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.52 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.82 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.52 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  43.15 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.54 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.44 
 
 		 369 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  46.79 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  47.15 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.82 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>