More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03901 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03901  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
415 aa  836    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1825  ATPase  73.86 
 
 
397 aa  585  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0510  ATPase  70.66 
 
 
392 aa  564  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136787  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0960  ATPase  54.91 
 
 
417 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.284254  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2050  ABC transporter-like  49.03 
 
 
439 aa  356  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3535  ABC transporter related  49.76 
 
 
431 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.31502  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2331  ABC transporter related  48.17 
 
 
413 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.884473  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2280  ABC transporter related  48.17 
 
 
413 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3139  ABC transporter-like protein protein  47.42 
 
 
427 aa  347  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 
357 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 
375 aa  320  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  46.02 
 
 
374 aa  318  7.999999999999999e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  46.39 
 
 
366 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  44.83 
 
 
375 aa  317  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  45.86 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  46.97 
 
 
370 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
381 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  45.19 
 
 
361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.05 
 
 
369 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
364 aa  309  6.999999999999999e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
371 aa  308  8e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  45.04 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  43.11 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.33 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  46.23 
 
 
357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  43.25 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  44.59 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.62 
 
 
357 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.6 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  42.4 
 
 
375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.62 
 
 
357 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  44.64 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  44.97 
 
 
364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.36 
 
 
357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  41.79 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  45.95 
 
 
363 aa  306  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  44.5 
 
 
385 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  44.65 
 
 
361 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  44.05 
 
 
359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 
349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  43.69 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  46.05 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 
349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  45.55 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.89 
 
 
358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 
357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  43.22 
 
 
372 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 
365 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
356 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  43.22 
 
 
368 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  41.67 
 
 
362 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  41.41 
 
 
362 aa  302  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.77 
 
 
351 aa  302  9e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1944  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  44.47 
 
 
356 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  46.79 
 
 
360 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
356 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  44.02 
 
 
363 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.03 
 
 
365 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.8 
 
 
351 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  44.7 
 
 
360 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  48.06 
 
 
357 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.7 
 
 
364 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43 
 
 
356 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  43.73 
 
 
352 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  43.22 
 
 
360 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.04 
 
 
356 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  41.73 
 
 
372 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.93 
 
 
367 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  42.68 
 
 
362 aa  299  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.12 
 
 
356 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.49 
 
 
356 aa  299  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  45.45 
 
 
353 aa  299  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  43.97 
 
 
368 aa  299  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  45.64 
 
 
355 aa  299  8e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  40.73 
 
 
373 aa  298  8e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  43.2 
 
 
378 aa  298  9e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  41.81 
 
 
380 aa  298  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 
351 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5438  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
369 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  43.53 
 
 
368 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  41.81 
 
 
366 aa  298  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  42.05 
 
 
356 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  42.05 
 
 
356 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.05 
 
 
356 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  42.16 
 
 
386 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.78 
 
 
357 aa  298  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  42.13 
 
 
362 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  39.9 
 
 
363 aa  297  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  40.98 
 
 
379 aa  298  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.67 
 
 
349 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  44.16 
 
 
363 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.05 
 
 
356 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  43.7 
 
 
366 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>