More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3315 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  100 
 
 		 342 aa  685    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  51.79 
 
 		 353 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  52.2 
 
 		 348 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  51.61 
 
 		 352 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  51.5 
 
 		 353 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  51.35 
 
 		 361 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 352 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2834  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  53.92 
 
 		 350 aa  305  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4340  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  50.44 
 
 		 343 aa  305  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  53.37 
 
 		 353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  50.44 
 
 		 343 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  50.44 
 
 		 343 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  50.15 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  50.44 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  50.15 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  48.94 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  48.94 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  49.26 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  49.26 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  48.64 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  52.82 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  56.23 
 
 		 353 aa  285  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  52.67 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  52.8 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3457  ABC transporter-related protein  52.31 
 
 		 361 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  51.96 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1210  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1413  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 342 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1406  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 342 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3076  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1540  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0496  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0657  ABC transporter, ATP-binding protein  51.03 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.59 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.51 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.49 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 348 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  44.03 
 
 		 343 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  47.64 
 
 		 365 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  41.94 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  41.4 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0686  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.18 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.02 
 
 		 353 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.22 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  46.83 
 
 		 350 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  41.76 
 
 		 348 aa  261  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.4 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  39.44 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.22 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.43 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.79 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  43.54 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  51.84 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 		 354 aa  259  7e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  47.53 
 
 		 363 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  44.69 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  47.68 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  42.25 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.67 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  47.59 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  47.85 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  40.37 
 
 		 376 aa  256  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.97 
 
 		 345 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  49.12 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  49.84 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  42.33 
 
 		 353 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.22 
 
 		 378 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.37 
 
 		 376 aa  255  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.22 
 
 		 378 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.22 
 
 		 378 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.22 
 
 		 378 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  42.15 
 
 		 346 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  46.98 
 
 		 342 aa  255  8e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  42.15 
 
 		 346 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.52 
 
 		 423 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  42.15 
 
 		 346 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.22 
 
 		 378 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2917  ABC transporter-like protein  44.44 
 
 		 351 aa  255  9e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.2 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  40.41 
 
 		 349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.89 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.77 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  40.24 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  44.08 
 
 		 374 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.46 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  46.88 
 
 		 346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  39.53 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  40.12 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.35 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.77 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>