More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3457 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3457  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 361 aa  708    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  70.7 
 
 		 353 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  72.42 
 
 		 353 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  52.31 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  51 
 
 		 353 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  50.97 
 
 		 348 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4340  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  50.14 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  50 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  48.59 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  50.42 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  50.42 
 
 		 343 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  51.69 
 
 		 352 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  50.14 
 
 		 343 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  50.14 
 
 		 343 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  49.3 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2834  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  49.44 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  49.01 
 
 		 343 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  48.62 
 
 		 350 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  47.13 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  49.43 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  48.85 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  48.13 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1210  ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3076  ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1406  ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1413  ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1540  ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0496  ABC transporter, ATP-binding protein  50.98 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0657  ABC transporter, ATP-binding protein  50.98 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.85 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.73 
 
 		 370 aa  259  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 		 353 aa  258  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  47.44 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.1 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.82 
 
 		 359 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.58 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.66 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.41 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  42.66 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.9 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  45.86 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  50.31 
 
 		 347 aa  253  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  49.16 
 
 		 344 aa  252  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.07 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  41.53 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  43.35 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.04 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  42.27 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  47.27 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  47.12 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.04 
 
 		 356 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.92 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  48.71 
 
 		 347 aa  248  8e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.93 
 
 		 357 aa  248  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.76 
 
 		 357 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  39.55 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  49.12 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.88 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  39.28 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.65 
 
 		 362 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.03 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.1 
 
 		 357 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  47.69 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.13 
 
 		 355 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  43.38 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  47.44 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  46.11 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  50.18 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  46.75 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.18 
 
 		 348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  45.48 
 
 		 353 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  45.96 
 
 		 360 aa  246  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  50.18 
 
 		 348 aa  245  8e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  43.34 
 
 		 357 aa  245  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  42.98 
 
 		 346 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  42.98 
 
 		 356 aa  245  9e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  46.01 
 
 		 347 aa  245  9e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  42.98 
 
 		 346 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 384 aa  245  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  42.98 
 
 		 346 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  51.01 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  44.51 
 
 		 350 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  44.01 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  46.15 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  44.92 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  45.63 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.99 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  54.31 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>