More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1504 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  100 
 
 
350 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  84.29 
 
 
348 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  82.02 
 
 
352 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  80.52 
 
 
343 aa  554  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  79.14 
 
 
343 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  79.14 
 
 
343 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4340  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  78.8 
 
 
343 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  77.65 
 
 
343 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  78.22 
 
 
343 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  78.22 
 
 
343 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2834  ABC transporter, ATP-binding protein  75.43 
 
 
342 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1210  ABC transporter, ATP-binding protein  76.57 
 
 
382 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3076  ABC transporter, ATP-binding protein  76.57 
 
 
342 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1540  ABC transporter, ATP-binding protein  76.57 
 
 
342 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0496  ABC transporter, ATP-binding protein  76.29 
 
 
342 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0657  ABC transporter, ATP-binding protein  76.29 
 
 
342 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1406  ABC transporter, ATP-binding protein  76.29 
 
 
342 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1413  ABC transporter, ATP-binding protein  76.29 
 
 
342 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11782  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  61.47 
 
 
353 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  62.61 
 
 
359 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  61.19 
 
 
353 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.56 
 
 
352 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  57.01 
 
 
361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  56.34 
 
 
353 aa  350  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  57.14 
 
 
353 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  54.81 
 
 
353 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  54.84 
 
 
351 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 
347 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  51.98 
 
 
343 aa  315  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  53.92 
 
 
342 aa  305  6e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  49.29 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  52.11 
 
 
353 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.44 
 
 
370 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  50 
 
 
353 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.92 
 
 
372 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.29 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  51.43 
 
 
341 aa  270  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.48 
 
 
352 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
344 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.97 
 
 
345 aa  265  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  44.6 
 
 
353 aa  265  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  44.55 
 
 
349 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.53 
 
 
352 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.11 
 
 
359 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.94 
 
 
356 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  46.83 
 
 
360 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.56 
 
 
353 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.99 
 
 
352 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3457  ABC transporter-related protein  48.62 
 
 
361 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  43.68 
 
 
353 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  45.27 
 
 
361 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.94 
 
 
356 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  49.66 
 
 
352 aa  260  3e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  43.68 
 
 
353 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.11 
 
 
373 aa  259  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.65 
 
 
384 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.78 
 
 
372 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 
353 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  46.45 
 
 
347 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.74 
 
 
355 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
349 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  43.35 
 
 
353 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 
353 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 
363 aa  257  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  45.98 
 
 
344 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  44.14 
 
 
355 aa  255  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  46.95 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  54.89 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  44.9 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  47.92 
 
 
363 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.79 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  46.34 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  43.81 
 
 
362 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  46.13 
 
 
372 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  44.38 
 
 
338 aa  252  7e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  53.25 
 
 
367 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  40.51 
 
 
363 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 
333 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  40.68 
 
 
356 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 
346 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  43.47 
 
 
386 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.81 
 
 
352 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.77 
 
 
378 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.01 
 
 
378 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 
361 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.12 
 
 
377 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.01 
 
 
378 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.45 
 
 
354 aa  251  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.15 
 
 
370 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.93 
 
 
370 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.01 
 
 
378 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.01 
 
 
378 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.38 
 
 
399 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.75 
 
 
357 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  38.39 
 
 
376 aa  249  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.71 
 
 
348 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  45.05 
 
 
347 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  43.12 
 
 
343 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  46.8 
 
 
378 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>