More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5228 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  99.09 
 
 		 329 aa  666    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  98.78 
 
 		 329 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  98.78 
 
 		 329 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 329 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  91.19 
 
 		 329 aa  620  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  91.41 
 
 		 326 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  91.1 
 
 		 326 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  86.93 
 
 		 329 aa  590  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  87.23 
 
 		 329 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  86.92 
 
 		 323 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  82.01 
 
 		 332 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  78.7 
 
 		 330 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  76.54 
 
 		 330 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  76.23 
 
 		 330 aa  512  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  76.78 
 
 		 330 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  62.39 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  60.74 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  61.01 
 
 		 343 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  59.17 
 
 		 367 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.65 
 
 		 365 aa  397  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 343 aa  394  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  59.72 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.36 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.85 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.85 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.57 
 
 		 362 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  58.6 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.7 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.98 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.98 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.37 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.92 
 
 		 375 aa  384  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  75.93 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.4 
 
 		 355 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  60.67 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  56.73 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.67 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  58 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  60.67 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  60.67 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  56.13 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  58 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.84 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.23 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  75.1 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.23 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  61.22 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 		 351 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  54.65 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  59.69 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.69 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.81 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  72.43 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.78 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  55.94 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  56.23 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  72.2 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  54.52 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.89 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  54.55 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  54.55 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  54.55 
 
 		 348 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  54.42 
 
 		 349 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 		 348 aa  361  9e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.75 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 386 aa  348  5e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.04 
 
 		 359 aa  348  6e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  68.75 
 
 		 345 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.52 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  51.57 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.87 
 
 		 363 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  68.03 
 
 		 363 aa  345  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  68.03 
 
 		 363 aa  345  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3312  hypothetical protein  56.84 
 
 		 325 aa  345  8e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.45 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.45 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.45 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.45 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.31 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  67.62 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  68.03 
 
 		 362 aa  342  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.06 
 
 		 359 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.33 
 
 		 351 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  67.9 
 
 		 365 aa  338  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  55 
 
 		 365 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  53.53 
 
 		 364 aa  338  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  67.9 
 
 		 365 aa  338  8e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  67.9 
 
 		 365 aa  338  8e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  54.57 
 
 		 356 aa  338  8e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  67.9 
 
 		 365 aa  338  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  67.9 
 
 		 365 aa  338  9e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  67.9 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>