More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0750 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4340  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  96.5 
 
 		 343 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  95.92 
 
 		 343 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  100 
 
 		 343 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  98.83 
 
 		 343 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  95.63 
 
 		 343 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  100 
 
 		 343 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  93 
 
 		 343 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2834  ABC transporter, ATP-binding protein  83.87 
 
 		 342 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  78.96 
 
 		 348 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1210  ABC transporter, ATP-binding protein  83.87 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1406  ABC transporter, ATP-binding protein  83.58 
 
 		 342 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3076  ABC transporter, ATP-binding protein  83.87 
 
 		 342 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1540  ABC transporter, ATP-binding protein  83.87 
 
 		 342 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1413  ABC transporter, ATP-binding protein  83.58 
 
 		 342 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  78.92 
 
 		 352 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  78.22 
 
 		 350 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0657  ABC transporter, ATP-binding protein  83.58 
 
 		 342 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0496  ABC transporter, ATP-binding protein  83.58 
 
 		 342 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  64 
 
 		 359 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  62.36 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  62.07 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  54.17 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  54.44 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  55.13 
 
 		 353 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  52.6 
 
 		 353 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  52.38 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 		 347 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  51.02 
 
 		 343 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  50.44 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  50.58 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  49.86 
 
 		 353 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.1 
 
 		 353 aa  278  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.18 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.01 
 
 		 359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  47.92 
 
 		 353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  48.24 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.6 
 
 		 352 aa  272  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  45.27 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  49.52 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  55.06 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3457  ABC transporter-related protein  50.14 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.86 
 
 		 372 aa  265  8.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.25 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.28 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.73 
 
 		 350 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.86 
 
 		 408 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  47.44 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  44.06 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  48.08 
 
 		 323 aa  258  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 344 aa  258  9e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.29 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.49 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  38.6 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.49 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.66 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  47.12 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.2 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.2 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.2 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.2 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.2 
 
 		 378 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 347 aa  255  8e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.11 
 
 		 376 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  56.22 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.35 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0068  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.63 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.63 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.63 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  51.91 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.63 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  45.59 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.63 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.72 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  53.63 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.63 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.63 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  44.32 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.63 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.68 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  43.69 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  40.68 
 
 		 354 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  51.82 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  48.52 
 
 		 352 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 		 354 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.41 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.34 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  48.23 
 
 		 338 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  47.81 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>