More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0734 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  100 
 
 
398 aa  795    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  87.53 
 
 
396 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  51.19 
 
 
359 aa  342  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  55.13 
 
 
345 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  56.41 
 
 
344 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  54.28 
 
 
345 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  51.08 
 
 
364 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  53.3 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  51.13 
 
 
344 aa  325  9e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  58.22 
 
 
349 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  58.22 
 
 
349 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  58.22 
 
 
349 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  55.91 
 
 
350 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  53.67 
 
 
346 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  47.98 
 
 
356 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 
345 aa  313  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  46.56 
 
 
349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 
349 aa  302  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  46.56 
 
 
349 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  50.72 
 
 
357 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  44.75 
 
 
384 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  44.82 
 
 
342 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  45.9 
 
 
352 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  44.02 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  47.81 
 
 
351 aa  272  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  47.27 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  47.42 
 
 
333 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  45.5 
 
 
374 aa  259  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  42.86 
 
 
342 aa  258  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  49.04 
 
 
346 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  47.12 
 
 
350 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.82 
 
 
352 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  46.69 
 
 
353 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  45.3 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  51.41 
 
 
349 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  45.4 
 
 
389 aa  251  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.81 
 
 
402 aa  249  9e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  47.78 
 
 
364 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  46.71 
 
 
364 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  39.22 
 
 
353 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.81 
 
 
353 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
387 aa  237  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.91 
 
 
359 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  41.39 
 
 
378 aa  237  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  41.27 
 
 
342 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.58 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  41.91 
 
 
366 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  38.66 
 
 
353 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.81 
 
 
353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.84 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  40.4 
 
 
353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  42.72 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  41.21 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  42.72 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  44.79 
 
 
378 aa  233  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 
381 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.02 
 
 
355 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00458  ATP-binding component of putrescine transport system  38.32 
 
 
419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0033874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.87 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 
377 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 
377 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 
377 aa  233  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 
353 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  42.86 
 
 
371 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.23 
 
 
363 aa  233  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.5 
 
 
352 aa  232  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  41.82 
 
 
377 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  42.24 
 
 
349 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  47.09 
 
 
345 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.59 
 
 
353 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.17 
 
 
377 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  42.99 
 
 
371 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.95 
 
 
372 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.69 
 
 
349 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.77 
 
 
370 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.88 
 
 
354 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  40.91 
 
 
343 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
355 aa  229  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.72 
 
 
361 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.02 
 
 
355 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1343  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 
378 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.25 
 
 
349 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  37.8 
 
 
377 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.8 
 
 
377 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.43 
 
 
395 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  37.8 
 
 
377 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.8 
 
 
377 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.8 
 
 
377 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.8 
 
 
377 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  42.77 
 
 
352 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.8 
 
 
377 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.72 
 
 
377 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40.73 
 
 
393 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.53 
 
 
387 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 
352 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.08 
 
 
349 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  43.29 
 
 
357 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1864  ABC transporter related  46.67 
 
 
361 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>