More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0605 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  87.53 
 
 		 398 aa  681    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  100 
 
 		 396 aa  795    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  53.21 
 
 		 359 aa  353  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  52.43 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  56.41 
 
 		 344 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  59.54 
 
 		 349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  59.54 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  59.54 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  51.89 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  56.88 
 
 		 345 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  54.31 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  51.4 
 
 		 344 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  55.59 
 
 		 350 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  55.94 
 
 		 345 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  47.99 
 
 		 356 aa  325  9e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  46.76 
 
 		 349 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 349 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  46.76 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  44.75 
 
 		 384 aa  295  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  49.73 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.95 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  50.57 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  44.9 
 
 		 342 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  45.26 
 
 		 352 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  46.2 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  46.34 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  45.38 
 
 		 374 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  47.76 
 
 		 350 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  45.69 
 
 		 342 aa  262  6.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  48.22 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  45.58 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  45.88 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.69 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.04 
 
 		 381 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  47.02 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  47.59 
 
 		 364 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 353 aa  249  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.67 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  41.52 
 
 		 371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.42 
 
 		 366 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  40.05 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 		 355 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  41.49 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.26 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.74 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  42.43 
 
 		 353 aa  243  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.25 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  45.43 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  39.83 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.94 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.94 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.94 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.94 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.72 
 
 		 377 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  43.62 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.88 
 
 		 354 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 		 423 aa  239  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  41.33 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  38.94 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  43.93 
 
 		 352 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  43.44 
 
 		 352 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  45.18 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.41 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.7 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  42.39 
 
 		 371 aa  236  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.88 
 
 		 352 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  43.35 
 
 		 389 aa  235  8e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.33 
 
 		 382 aa  235  8e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  40.9 
 
 		 360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  40.9 
 
 		 360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.23 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  44.24 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  38.23 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  41.32 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.72 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 		 388 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0823  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.05 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  40.73 
 
 		 362 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  40.89 
 
 		 342 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.83 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.98 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.03 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  41.21 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  42.72 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.86 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  42.02 
 
 		 360 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 378 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>