More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3948 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
349 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  66.67 
 
 
352 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  67.81 
 
 
352 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  56.2 
 
 
357 aa  322  8e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  49.57 
 
 
364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  46.86 
 
 
384 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
346 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  50.14 
 
 
359 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  43.94 
 
 
356 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  50.5 
 
 
344 aa  288  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  45.93 
 
 
342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  47.95 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  49.57 
 
 
350 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  47.84 
 
 
345 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  48.27 
 
 
342 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  50.71 
 
 
351 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  48.57 
 
 
348 aa  279  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  51.29 
 
 
353 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  50.47 
 
 
349 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  50.47 
 
 
349 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  50.47 
 
 
349 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  50.32 
 
 
345 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 
333 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  51.45 
 
 
374 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  46.2 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  45.94 
 
 
349 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  45.94 
 
 
349 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.94 
 
 
349 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  51.08 
 
 
345 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  51.76 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  45.45 
 
 
350 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  45.61 
 
 
369 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  47.13 
 
 
346 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.98 
 
 
355 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
341 aa  245  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  46.47 
 
 
352 aa  243  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  41.44 
 
 
359 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  40.67 
 
 
357 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  43.95 
 
 
353 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.97 
 
 
359 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  42.86 
 
 
389 aa  239  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.71 
 
 
366 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  49.86 
 
 
345 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  43.57 
 
 
387 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.94 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  41.21 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  48.62 
 
 
364 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  43.27 
 
 
410 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 
356 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  45.22 
 
 
363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  47.99 
 
 
352 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.57 
 
 
352 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  42.32 
 
 
354 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.49 
 
 
377 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  46.46 
 
 
359 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.84 
 
 
354 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  42.03 
 
 
355 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.13 
 
 
356 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  48.79 
 
 
378 aa  229  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  45.66 
 
 
386 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  42.49 
 
 
344 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  45.1 
 
 
357 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  42.4 
 
 
365 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  42.11 
 
 
369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  54.27 
 
 
387 aa  226  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  38.76 
 
 
362 aa  225  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 
364 aa  225  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  42.77 
 
 
378 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  40.82 
 
 
369 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  42.47 
 
 
369 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.44 
 
 
349 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  41.4 
 
 
375 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  42.45 
 
 
366 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.74 
 
 
359 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
353 aa  222  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  40 
 
 
375 aa  222  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  43.27 
 
 
368 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  41.11 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  41.43 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  44.35 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.09 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  44.35 
 
 
527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  43.9 
 
 
356 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  39.65 
 
 
361 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 
353 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 
372 aa  219  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.18 
 
 
353 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  43.86 
 
 
362 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.9 
 
 
352 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  41.99 
 
 
329 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  44.56 
 
 
363 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.94 
 
 
373 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  40.94 
 
 
369 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.19 
 
 
370 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  44.56 
 
 
363 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  40.34 
 
 
371 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  40.74 
 
 
353 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  38.98 
 
 
358 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>