More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0809 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  100 
 
 
375 aa  767    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  68.39 
 
 
361 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  58.29 
 
 
369 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  58.09 
 
 
347 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  56.2 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  55.43 
 
 
368 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  57.39 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  57.1 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  56.7 
 
 
369 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  55.97 
 
 
369 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  53.14 
 
 
358 aa  391  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  56.85 
 
 
369 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  57.31 
 
 
357 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  56.03 
 
 
369 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  54 
 
 
355 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  55.36 
 
 
371 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  54.15 
 
 
359 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  52.56 
 
 
357 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 
360 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 
360 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  50.56 
 
 
386 aa  339  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  47.85 
 
 
348 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  50.71 
 
 
358 aa  335  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  50.71 
 
 
358 aa  335  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  48.61 
 
 
361 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  47.25 
 
 
355 aa  329  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  48.75 
 
 
365 aa  329  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  49.72 
 
 
354 aa  328  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  47.09 
 
 
405 aa  323  3e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  50.29 
 
 
355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  48.68 
 
 
353 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  46.38 
 
 
376 aa  312  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  46.35 
 
 
410 aa  305  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  45.58 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
415 aa  299  5e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  48.14 
 
 
372 aa  297  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  44.15 
 
 
342 aa  292  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  47.25 
 
 
389 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  42.03 
 
 
343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  59.24 
 
 
257 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  46.4 
 
 
342 aa  285  7e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  42.69 
 
 
342 aa  285  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  58.82 
 
 
257 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  42.2 
 
 
343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  58.02 
 
 
257 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  58.44 
 
 
257 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  57.61 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.51 
 
 
387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  57.61 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  41.52 
 
 
343 aa  282  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  57.2 
 
 
257 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 
343 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  42.07 
 
 
342 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  44.23 
 
 
389 aa  279  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.2 
 
 
259 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  44.54 
 
 
377 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 
350 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.4 
 
 
349 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  40.64 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  40.68 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  40.68 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  40.68 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  44.48 
 
 
390 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  44.82 
 
 
368 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.95 
 
 
346 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  40.68 
 
 
349 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  40.4 
 
 
349 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  40.4 
 
 
349 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  45.54 
 
 
357 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  40.11 
 
 
349 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  42.42 
 
 
389 aa  270  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  46.28 
 
 
360 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  40.49 
 
 
366 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  43.98 
 
 
378 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  43.15 
 
 
350 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  42.54 
 
 
371 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  42.62 
 
 
362 aa  262  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  47.35 
 
 
346 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  57.2 
 
 
256 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  43.87 
 
 
373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
256 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
256 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
256 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
256 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  57.2 
 
 
256 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.2 
 
 
256 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 
341 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  42.48 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  40.56 
 
 
373 aa  253  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  40.38 
 
 
378 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  39.14 
 
 
353 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.27 
 
 
342 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  40.11 
 
 
361 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  42.9 
 
 
347 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  43.67 
 
 
367 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.45 
 
 
367 aa  249  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.77 
 
 
355 aa  249  8e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 
362 aa  248  9e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>