More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1508 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  100 
 
 
376 aa  743    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  74.93 
 
 
354 aa  544  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  72.27 
 
 
386 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  71.12 
 
 
358 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  71.12 
 
 
358 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  68.98 
 
 
361 aa  511  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  67.65 
 
 
365 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  66.93 
 
 
410 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  60.64 
 
 
356 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  63.97 
 
 
389 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  56.03 
 
 
359 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  53.55 
 
 
357 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  55.12 
 
 
355 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  55.68 
 
 
369 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  51.74 
 
 
347 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  53.91 
 
 
369 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  53.07 
 
 
369 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  53.07 
 
 
369 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  49.2 
 
 
361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  52.79 
 
 
369 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  53.09 
 
 
369 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  52.08 
 
 
357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  51.94 
 
 
368 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  49.87 
 
 
348 aa  332  8e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  50 
 
 
353 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 
353 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  50.67 
 
 
369 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  46.63 
 
 
405 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  44.74 
 
 
355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  45.07 
 
 
358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  46.38 
 
 
375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  48.66 
 
 
371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  51.34 
 
 
360 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  49.3 
 
 
415 aa  297  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  51.08 
 
 
360 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  47.53 
 
 
355 aa  292  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  48.46 
 
 
372 aa  291  9e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  63.88 
 
 
257 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  62.01 
 
 
257 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  62.56 
 
 
257 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  62.56 
 
 
257 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.39 
 
 
259 aa  278  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  62.56 
 
 
257 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  62.11 
 
 
257 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  62.11 
 
 
257 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  42.05 
 
 
390 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  63.39 
 
 
256 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  63.39 
 
 
256 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  63.39 
 
 
256 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  63.39 
 
 
256 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  63.39 
 
 
256 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.95 
 
 
256 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  62.95 
 
 
256 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.98 
 
 
342 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  45.18 
 
 
346 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.52 
 
 
366 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  49.25 
 
 
349 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  49.25 
 
 
349 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  48.87 
 
 
349 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3701  ABC transporter related  62.56 
 
 
228 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  48.5 
 
 
349 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  49.41 
 
 
349 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 
343 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  39.15 
 
 
378 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  38.11 
 
 
360 aa  248  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 
346 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
343 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  48.7 
 
 
349 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  49.8 
 
 
349 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 
349 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  44.29 
 
 
360 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  44.29 
 
 
360 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  49.8 
 
 
349 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  40.16 
 
 
368 aa  239  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  46.51 
 
 
342 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  37.99 
 
 
343 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  38.16 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  38.66 
 
 
377 aa  232  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  50.91 
 
 
350 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  51.48 
 
 
355 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 
341 aa  230  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  47.21 
 
 
342 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  47.69 
 
 
342 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  48.44 
 
 
342 aa  229  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  46.64 
 
 
343 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  43.75 
 
 
342 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  41.05 
 
 
378 aa  226  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  39.89 
 
 
389 aa  226  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  38.16 
 
 
361 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  37.3 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  51.84 
 
 
363 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 
349 aa  220  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
352 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
361 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  53.16 
 
 
352 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  43.11 
 
 
367 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
382 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0297  ABC transporter related  42.86 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.292775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  48.64 
 
 
364 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.82 
 
 
363 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>