More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0297 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0297  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  742    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.292775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  70.22 
 
 
394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3962  ABC transporter related  55.34 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5570  ABC transporter related protein  51.54 
 
 
365 aa  355  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  41.44 
 
 
366 aa  288  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  49.49 
 
 
398 aa  286  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  41.55 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  41.08 
 
 
369 aa  282  5.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  42.16 
 
 
367 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  42.16 
 
 
367 aa  281  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  41.42 
 
 
360 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  42.11 
 
 
365 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  41.42 
 
 
360 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  39.78 
 
 
367 aa  278  9e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  48.16 
 
 
356 aa  277  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  41.6 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.5 
 
 
351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  41.78 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  41.73 
 
 
362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  54.66 
 
 
369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  41.39 
 
 
368 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.16 
 
 
366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
368 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  47.16 
 
 
366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  47.83 
 
 
366 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  42.54 
 
 
360 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  49.63 
 
 
371 aa  272  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  46.62 
 
 
355 aa  271  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.8 
 
 
369 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  40.21 
 
 
384 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  43.8 
 
 
361 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  41.46 
 
 
349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  46.94 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  47.72 
 
 
338 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  45.79 
 
 
365 aa  270  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  49.49 
 
 
358 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  41.16 
 
 
364 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  52.19 
 
 
369 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.63 
 
 
364 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  45.81 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  41.37 
 
 
359 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  47.28 
 
 
357 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  47.74 
 
 
355 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.23 
 
 
364 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2481  ABC transporter related  46.69 
 
 
316 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869915  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  40.56 
 
 
361 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  42.38 
 
 
363 aa  267  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  41.48 
 
 
353 aa  267  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.66 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  41.24 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  41.26 
 
 
373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  43.5 
 
 
363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  46.79 
 
 
369 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  43.23 
 
 
350 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5388  ABC transporter related  48.21 
 
 
352 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  39.78 
 
 
364 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  44.38 
 
 
347 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  38.67 
 
 
378 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  39.23 
 
 
377 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  39.11 
 
 
352 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3482  ABC transporter related protein  51.35 
 
 
384 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.815806  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  50 
 
 
364 aa  265  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.26 
 
 
369 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 
406 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  50 
 
 
364 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 
375 aa  265  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  39.67 
 
 
379 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
364 aa  264  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  48.67 
 
 
372 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52 
 
 
370 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  50.8 
 
 
410 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  45.67 
 
 
353 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  40.05 
 
 
354 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  51 
 
 
393 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0094  ABC transporter related  40.75 
 
 
367 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00776144  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.37 
 
 
369 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  45.51 
 
 
360 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  40.16 
 
 
368 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.94 
 
 
402 aa  263  3e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  43.81 
 
 
372 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.5 
 
 
349 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  43.22 
 
 
352 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  46.33 
 
 
405 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  41.37 
 
 
355 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  46.33 
 
 
405 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  46.33 
 
 
405 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
364 aa  263  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
352 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  38.96 
 
 
360 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  45.21 
 
 
369 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  41.55 
 
 
360 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  40.38 
 
 
355 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 
371 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
367 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  42.23 
 
 
371 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>