More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3482 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3482  ABC transporter related protein  100 
 
 		 384 aa  770    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.815806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5570  ABC transporter related protein  44.99 
 
 		 365 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  41.3 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  40.66 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3962  ABC transporter related  55.37 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  43.22 
 
 		 352 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  52.85 
 
 		 359 aa  272  9e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  40.7 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  42.82 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5670  ABC transporter related  51.46 
 
 		 395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0297  ABC transporter related  51.35 
 
 		 359 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.292775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  40.73 
 
 		 351 aa  265  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  52.96 
 
 		 363 aa  265  8e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.61 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.4 
 
 		 355 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  49.23 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  51.21 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  49 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  50.81 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  47.83 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  49.6 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3448  ABC transporter related  44.34 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  49.6 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  46.93 
 
 		 368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  49.6 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  49 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  49.8 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  49.41 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.81 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  49.39 
 
 		 364 aa  258  8e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5705  ABC transporter related  41.55 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  47.78 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  49.6 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  47.58 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  40.92 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.94 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  39.55 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.89 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  50.2 
 
 		 353 aa  258  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  47.91 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  41.1 
 
 		 352 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  47.94 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  49.24 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  44.13 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  43.75 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 372 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  50.18 
 
 		 353 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  39.67 
 
 		 361 aa  256  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  45.8 
 
 		 370 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  41.46 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  49.05 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  46.97 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.55 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  46.97 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  42.62 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  48.99 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  46.97 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  51.54 
 
 		 357 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.2 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  37.97 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  49.22 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 351 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2481  ABC transporter related  43.83 
 
 		 316 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869915  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  42.58 
 
 		 349 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  49.6 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  48.01 
 
 		 380 aa  252  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  47.69 
 
 		 360 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  48.13 
 
 		 372 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  47.27 
 
 		 363 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  48.81 
 
 		 366 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.89 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  49.62 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  47.16 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  48.01 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  53.04 
 
 		 362 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  47.16 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  47.33 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  47.01 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  46.44 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  47.16 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2348  ABC transporter related  41.18 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.917479  normal  0.103865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  40.3 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  47.31 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  39.52 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  48.4 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  48.48 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.44 
 
 		 365 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  48.78 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  47.78 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  47.78 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  47.78 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>