More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5570 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5570  ABC transporter related protein  100 
 
 
365 aa  741    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3962  ABC transporter related  55.17 
 
 
378 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  49.72 
 
 
394 aa  359  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0297  ABC transporter related  51.54 
 
 
359 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.292775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  43.94 
 
 
366 aa  290  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  43.75 
 
 
369 aa  287  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  42.59 
 
 
367 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  42.59 
 
 
367 aa  287  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  50.33 
 
 
357 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  53.6 
 
 
356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  42.86 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  42.36 
 
 
365 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  48.84 
 
 
353 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  43.55 
 
 
382 aa  282  7.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  43.06 
 
 
349 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  42.15 
 
 
353 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3482  ABC transporter related protein  44.99 
 
 
384 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.815806  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  39.95 
 
 
370 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  45.97 
 
 
370 aa  278  8e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  43.56 
 
 
360 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.14 
 
 
363 aa  278  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  41.78 
 
 
356 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  40 
 
 
349 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5388  ABC transporter related  42.65 
 
 
352 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  40.66 
 
 
366 aa  277  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  43.29 
 
 
360 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.08 
 
 
351 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  41.32 
 
 
353 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  45.32 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  43.32 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  39.72 
 
 
350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.7 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.81 
 
 
351 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 
364 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  40.93 
 
 
351 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.73 
 
 
351 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  42.78 
 
 
362 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 
366 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  43.51 
 
 
365 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  40.32 
 
 
402 aa  272  8.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  40.32 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  39.35 
 
 
370 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.42 
 
 
355 aa  271  9e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.8 
 
 
366 aa  271  9e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  40.8 
 
 
366 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  51.2 
 
 
410 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 
364 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  40.22 
 
 
381 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.4 
 
 
369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  42.58 
 
 
353 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
369 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  47.6 
 
 
365 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  41.35 
 
 
380 aa  269  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  44.92 
 
 
426 aa  269  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  42.81 
 
 
383 aa  269  5e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  43.14 
 
 
364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  41.53 
 
 
366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  39.01 
 
 
373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  53.01 
 
 
409 aa  269  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  46.51 
 
 
392 aa  269  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  41.87 
 
 
367 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
404 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
374 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  41.85 
 
 
353 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  41.67 
 
 
367 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  48.47 
 
 
360 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  50.8 
 
 
404 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  41.53 
 
 
366 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  39.61 
 
 
352 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  48.78 
 
 
348 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.08 
 
 
359 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  42.81 
 
 
364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 
406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  47.81 
 
 
353 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  41.72 
 
 
365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  42.81 
 
 
364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  40.27 
 
 
374 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  38.01 
 
 
372 aa  266  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  42.05 
 
 
349 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.5 
 
 
350 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  46.02 
 
 
356 aa  265  5.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4866  ABC transporter related  41.82 
 
 
365 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.112341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  42.02 
 
 
357 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  44.12 
 
 
356 aa  265  7e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  41.8 
 
 
377 aa  265  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  38.32 
 
 
363 aa  265  8e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  37.43 
 
 
366 aa  264  1e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
364 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  42.39 
 
 
367 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.04 
 
 
362 aa  265  1e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  37.43 
 
 
366 aa  264  1e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  43.73 
 
 
358 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  40.81 
 
 
370 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  40.93 
 
 
382 aa  264  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  45.64 
 
 
371 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 
363 aa  264  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 
350 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  42.01 
 
 
365 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  41.29 
 
 
376 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  41.19 
 
 
370 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>