More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0297 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  100 
 
 		 371 aa  753    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  68.59 
 
 		 347 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  57.39 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  55.97 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  56.86 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  55.36 
 
 		 375 aa  391  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  56.23 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  56.03 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  54.83 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  52.91 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  54.52 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  53.46 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  55.36 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  51.01 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  53.64 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  53.89 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  52.39 
 
 		 358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  52.39 
 
 		 358 aa  355  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  52.68 
 
 		 354 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  53.49 
 
 		 353 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  51.98 
 
 		 386 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  52.39 
 
 		 361 aa  348  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  52.3 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  54.19 
 
 		 357 aa  345  8e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  55.52 
 
 		 360 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  55.3 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  50.7 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  53.12 
 
 		 356 aa  332  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  48.66 
 
 		 376 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  50.14 
 
 		 410 aa  326  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  51.3 
 
 		 353 aa  325  6e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  45.95 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  50.14 
 
 		 415 aa  315  8e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  47.97 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  51.93 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  49.86 
 
 		 372 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 387 aa  302  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 346 aa  302  7.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  63.37 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  41.69 
 
 		 343 aa  296  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  62.96 
 
 		 257 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  63.79 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  62.55 
 
 		 257 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  62.96 
 
 		 257 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  62.96 
 
 		 257 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  62.96 
 
 		 257 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  44.02 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  47.11 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  41.81 
 
 		 342 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  42.2 
 
 		 343 aa  285  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.32 
 
 		 259 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  40.52 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  42.86 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  44.29 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  45.12 
 
 		 349 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  43.18 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  42.18 
 
 		 360 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  43.18 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  43.54 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  42.9 
 
 		 349 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  43.06 
 
 		 349 aa  275  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.5 
 
 		 377 aa  275  9e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  45.02 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  41.79 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  42.25 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  45.43 
 
 		 357 aa  269  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  42.12 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  44.32 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  43.75 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  61.32 
 
 		 256 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 256 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  61.32 
 
 		 256 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  61.32 
 
 		 256 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  61.32 
 
 		 256 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  45.48 
 
 		 378 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  60.91 
 
 		 256 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.91 
 
 		 256 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  47.29 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  46.49 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 		 350 aa  259  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  46.23 
 
 		 350 aa  258  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  46.09 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  46.09 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.65 
 
 		 378 aa  253  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.65 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  44.84 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  46.32 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  47.06 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.85 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  50.51 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.35 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  45.8 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 373 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  43.65 
 
 		 373 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  42.27 
 
 		 349 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.34 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>