More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002576 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  88.63 
 
 
343 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
343 aa  709    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  78.43 
 
 
343 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  62.28 
 
 
346 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  47.26 
 
 
349 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  47.26 
 
 
349 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  47.26 
 
 
349 aa  332  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  52.48 
 
 
342 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  46.97 
 
 
349 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  46.97 
 
 
349 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  47.65 
 
 
342 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  47.94 
 
 
343 aa  330  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  47.65 
 
 
342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  50.33 
 
 
342 aa  327  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  45.82 
 
 
349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 
349 aa  325  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
349 aa  324  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  46.11 
 
 
349 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  46.11 
 
 
349 aa  322  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  50.5 
 
 
350 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49.35 
 
 
341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.11 
 
 
358 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.94 
 
 
347 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  41.64 
 
 
361 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
361 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  42.45 
 
 
369 aa  292  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  43.67 
 
 
361 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  46.53 
 
 
369 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  45.75 
 
 
366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  42.9 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  42.03 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  42.82 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  42.82 
 
 
369 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  42.82 
 
 
369 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 
353 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  44.18 
 
 
369 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  42.44 
 
 
369 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  41.69 
 
 
371 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  41.91 
 
 
348 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  42.29 
 
 
377 aa  279  6e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  42 
 
 
386 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  44.08 
 
 
378 aa  276  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  42.48 
 
 
354 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  43.27 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  38.71 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  42.06 
 
 
357 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.06 
 
 
355 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.69 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.52 
 
 
359 aa  268  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  41.55 
 
 
354 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  39.38 
 
 
355 aa  265  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  41.43 
 
 
389 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  43.14 
 
 
346 aa  262  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  40.57 
 
 
358 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  40.12 
 
 
354 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  40.29 
 
 
358 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  44.67 
 
 
355 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  42.12 
 
 
356 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  40.92 
 
 
360 aa  259  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  43.11 
 
 
360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  43.11 
 
 
360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.63 
 
 
259 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  41.93 
 
 
365 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  38.68 
 
 
361 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  51.05 
 
 
257 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  51.9 
 
 
257 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 
343 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  51.9 
 
 
257 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 
257 aa  255  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  51.9 
 
 
257 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  51.9 
 
 
257 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  40.7 
 
 
405 aa  255  9e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  51.05 
 
 
257 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  40.65 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  39.77 
 
 
352 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  39.18 
 
 
342 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  41.38 
 
 
360 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  43.55 
 
 
379 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 
360 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  38.76 
 
 
376 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  42.51 
 
 
368 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  39.07 
 
 
357 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  39.71 
 
 
399 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1014  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 
372 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  38.97 
 
 
410 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  48.67 
 
 
333 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  39.77 
 
 
329 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  43.33 
 
 
352 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
353 aa  247  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  42.62 
 
 
364 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  39.81 
 
 
353 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  40 
 
 
336 aa  245  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  39.81 
 
 
353 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  39.94 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  42.06 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  35.64 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  39.04 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
376 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.17 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 
352 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>