More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3345 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  96.85 
 
 		 349 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  100 
 
 		 349 aa  711    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  98.57 
 
 		 349 aa  701    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  97.99 
 
 		 349 aa  698    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  87.39 
 
 		 349 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  86.82 
 
 		 349 aa  620  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  86.82 
 
 		 349 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  87.11 
 
 		 349 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  85.67 
 
 		 349 aa  614  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  69.57 
 
 		 342 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  68.41 
 
 		 342 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  67.25 
 
 		 342 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  66.76 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  65.8 
 
 		 342 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 346 aa  335  5e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 		 343 aa  332  8e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  49.43 
 
 		 350 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  47.26 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 343 aa  326  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  46.41 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  45.6 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.49 
 
 		 347 aa  278  7e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  44.31 
 
 		 369 aa  278  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  44.02 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  44.41 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  44.61 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  43.73 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  42.33 
 
 		 369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  43.82 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  45.57 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  43.82 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  42.9 
 
 		 369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  41.74 
 
 		 357 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  46.51 
 
 		 342 aa  272  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  46.69 
 
 		 355 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  48.11 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  45.95 
 
 		 346 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  40.4 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  42.12 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  40.11 
 
 		 375 aa  265  8e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  43.24 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  39.24 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  41.52 
 
 		 378 aa  262  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  41.45 
 
 		 355 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  39.71 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  41.49 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  42.65 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.9 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  49.64 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.47 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  39.54 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  51.2 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  51.2 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  52.42 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  42.68 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  42.02 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  42.37 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  43.85 
 
 		 368 aa  252  6e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  52.26 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1014  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.82 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  41.43 
 
 		 377 aa  250  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  48.7 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  40.17 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  40.46 
 
 		 330 aa  245  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  38.73 
 
 		 360 aa  245  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  44.3 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  42.44 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  40.29 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.33 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  38.9 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.4 
 
 		 365 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.43 
 
 		 367 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  41.34 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  42.19 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.4 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.051022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6603  ABC transporter related protein  40.88 
 
 		 351 aa  238  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  42.01 
 
 		 364 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  39.68 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  37.18 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  39.83 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.07 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6246  ABC transporter related  38.72 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836052  normal  0.532087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  41.74 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.94 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  41.56 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  41.25 
 
 		 333 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  37.71 
 
 		 329 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 348 aa  235  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  37.25 
 
 		 336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  42.17 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  38 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.73 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>