More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3343 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  100 
 
 
348 aa  721    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  89.94 
 
 
348 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  93.97 
 
 
348 aa  680    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  81.79 
 
 
349 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  81.21 
 
 
349 aa  594  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  78.45 
 
 
353 aa  578  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  66.86 
 
 
351 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  62.32 
 
 
349 aa  443  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  50.15 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  52.77 
 
 
349 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  51.3 
 
 
353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 
353 aa  309  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  48.06 
 
 
353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  49.2 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.98 
 
 
359 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  45.86 
 
 
337 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  46.38 
 
 
352 aa  298  9e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  47.8 
 
 
350 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  43.63 
 
 
357 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  48.38 
 
 
353 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  48.7 
 
 
353 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.86 
 
 
345 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.45 
 
 
370 aa  293  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  50.32 
 
 
353 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.74 
 
 
353 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 
353 aa  292  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 
353 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.1 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.48 
 
 
372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  45.61 
 
 
356 aa  288  7e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.3 
 
 
353 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.32 
 
 
359 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.93 
 
 
359 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  47.22 
 
 
358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.49 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  46.23 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  43.18 
 
 
353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.6 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  44.67 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  49.3 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  43.43 
 
 
352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.21 
 
 
356 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  42.86 
 
 
364 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  47.37 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  46.1 
 
 
339 aa  282  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  45.77 
 
 
339 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.47 
 
 
376 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.78 
 
 
377 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.88 
 
 
354 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  45.2 
 
 
353 aa  279  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  44.59 
 
 
353 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
376 aa  278  7e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.83 
 
 
363 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  53.91 
 
 
386 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.9 
 
 
354 aa  276  3e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  48.72 
 
 
364 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.65 
 
 
362 aa  276  3e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  41.57 
 
 
353 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.21 
 
 
352 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.69 
 
 
358 aa  276  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 
363 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.39 
 
 
372 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  47.1 
 
 
347 aa  275  6e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  44.52 
 
 
346 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  44.52 
 
 
346 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  44.52 
 
 
346 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 
349 aa  275  8e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  42.42 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  43.93 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.31 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  44.48 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.75 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.24 
 
 
408 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.46 
 
 
370 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  43.14 
 
 
367 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  43.41 
 
 
350 aa  273  5.000000000000001e-72  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  42.59 
 
 
329 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  43.08 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  37.86 
 
 
352 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  48.23 
 
 
353 aa  272  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  44.51 
 
 
352 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.96 
 
 
399 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.73 
 
 
359 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 
362 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.39 
 
 
346 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.48 
 
 
373 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  47.99 
 
 
366 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  47.08 
 
 
405 aa  270  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  42.31 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  41.95 
 
 
352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  41.23 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 
379 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 
357 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4466  ABC transporter-like  44.37 
 
 
351 aa  269  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.29 
 
 
365 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  43.24 
 
 
342 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  46.32 
 
 
364 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.7 
 
 
377 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 
386 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  42.81 
 
 
374 aa  269  5e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>