More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0011 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  100 
 
 		 359 aa  744    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.43 
 
 		 354 aa  350  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  51.08 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  47.32 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  44.25 
 
 		 358 aa  295  7e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  51.19 
 
 		 344 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 376 aa  293  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  46.63 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  45.12 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  46.27 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  45.75 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 370 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.45 
 
 		 353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  47.25 
 
 		 353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  48.55 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.34 
 
 		 352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  47.02 
 
 		 350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  48.23 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  43.84 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  44.31 
 
 		 344 aa  282  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  47.15 
 
 		 353 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  41.55 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  45.65 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.17 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 353 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  41.55 
 
 		 352 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.83 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.47 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  42.41 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  45.31 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0686  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.51 
 
 		 364 aa  280  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 		 353 aa  279  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  49.12 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.51 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  43.02 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.58 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  46.43 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  46.65 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.21 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  42.41 
 
 		 329 aa  277  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  47.9 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 353 aa  276  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  42.74 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.71 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  43.31 
 
 		 348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.82 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  48.95 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  44.21 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  43.8 
 
 		 367 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  43.8 
 
 		 367 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  43.03 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.63 
 
 		 349 aa  272  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1841  ABC transporter related  43.6 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.69 
 
 		 357 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  42.18 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 		 364 aa  272  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 		 348 aa  271  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  46.81 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  46.62 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.58 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.97 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  46.92 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.94 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.26 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  42.37 
 
 		 348 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.94 
 
 		 380 aa  270  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  46.43 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.78 
 
 		 384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.4 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.2 
 
 		 358 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.12 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.45 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.82 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.66 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  41.39 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  41.34 
 
 		 350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  41.14 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.81 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  43.91 
 
 		 364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.04 
 
 		 373 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.28 
 
 		 378 aa  266  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  46.69 
 
 		 352 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.74 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 349 aa  266  5.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.06 
 
 		 356 aa  266  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.81 
 
 		 341 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  41.6 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.38 
 
 		 367 aa  265  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>