More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1031 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  100 
 
 		 339 aa  699    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  83.19 
 
 		 339 aa  591  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  57.27 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.47 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  59.33 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  58.41 
 
 		 329 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  59.32 
 
 		 329 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.57 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  58.72 
 
 		 329 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  59.63 
 
 		 329 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  56.57 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  56.57 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  54.3 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  55 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  57.54 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0755  ABC transporter, ATP-binding protein  53.29 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.547928  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  50.45 
 
 		 333 aa  315  6e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0832  ABC transporter, ATP-binding protein  54.69 
 
 		 317 aa  299  6e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.74 
 
 		 353 aa  298  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.54 
 
 		 353 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.69 
 
 		 353 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  46.29 
 
 		 333 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.68 
 
 		 370 aa  292  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 		 366 aa  292  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.66 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  45.88 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 353 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 337 aa  289  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 348 aa  289  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  42.74 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  44.44 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  47.33 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 349 aa  285  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  42.02 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  46.1 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 		 352 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  43.66 
 
 		 352 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.17 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.48 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.78 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  42.66 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.76 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  44.58 
 
 		 352 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.34 
 
 		 360 aa  274  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  41.38 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  52.08 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  50.42 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  44.21 
 
 		 351 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  41.81 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  45.72 
 
 		 350 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  46.1 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.48 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  41.19 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 363 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 		 378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.45 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  40.34 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  49.08 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.86 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  43.67 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  50.63 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  43.75 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  49.17 
 
 		 357 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  52.08 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 367 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.11 
 
 		 352 aa  266  5e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.59 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  41 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  39.78 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  42.44 
 
 		 339 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  44.64 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  50.42 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  51.88 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  41.93 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  52.72 
 
 		 374 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 352 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  44.82 
 
 		 366 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 		 374 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  44.9 
 
 		 338 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  51.06 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28040  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.71 
 
 		 350 aa  263  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.539146  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  41.21 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.72 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  41.87 
 
 		 391 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.25 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.25 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>