More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6870 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  100 
 
 
391 aa  777    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  70.56 
 
 
399 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  61.68 
 
 
389 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  61.58 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  56.29 
 
 
350 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 
350 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  54.97 
 
 
366 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  53.39 
 
 
359 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  55.4 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  52.96 
 
 
359 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1206  ABC transporter related  53.5 
 
 
359 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1685  ABC transporter related  53.5 
 
 
359 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  53.5 
 
 
359 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  52 
 
 
365 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4846  ABC transporter, ATPase subunit  53.65 
 
 
359 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  decreased coverage  0.000133931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1591  ABC transporter related  53.37 
 
 
359 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1610  ABC transporter related  53.37 
 
 
359 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1561  ABC transporter related  52.81 
 
 
359 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  41.19 
 
 
368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.74 
 
 
350 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
343 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.18 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  43.02 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  44.51 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  50.17 
 
 
360 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  48.6 
 
 
358 aa  280  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  44.77 
 
 
328 aa  279  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  48.02 
 
 
365 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
367 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  41.91 
 
 
382 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  50.17 
 
 
360 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  50.17 
 
 
360 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.18 
 
 
369 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  41.76 
 
 
382 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  48.36 
 
 
363 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.95 
 
 
346 aa  276  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  47.38 
 
 
353 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  45.24 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.1 
 
 
381 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  42.66 
 
 
360 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 
369 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  50.17 
 
 
360 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  50.17 
 
 
360 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  41.49 
 
 
382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  50 
 
 
359 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  48.03 
 
 
363 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
360 aa  272  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  48.97 
 
 
339 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  41.49 
 
 
382 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 
342 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  44.57 
 
 
361 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.65 
 
 
365 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  45.66 
 
 
376 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  45.39 
 
 
355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.9 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.61 
 
 
373 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  40.82 
 
 
365 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  48.44 
 
 
348 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.8 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.9 
 
 
366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  45.05 
 
 
355 aa  269  7e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  49.31 
 
 
356 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  46.79 
 
 
361 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.27 
 
 
352 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  54.22 
 
 
342 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  40.68 
 
 
353 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  42.9 
 
 
361 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  41.58 
 
 
362 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.17 
 
 
374 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  53.75 
 
 
342 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.21 
 
 
353 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.58 
 
 
355 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  45.86 
 
 
358 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  49.31 
 
 
356 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  54.04 
 
 
364 aa  266  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 
353 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  48.62 
 
 
359 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  44.2 
 
 
358 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.25 
 
 
368 aa  266  7e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  40.61 
 
 
360 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.83 
 
 
374 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  49.83 
 
 
374 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  45.92 
 
 
375 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  42.09 
 
 
355 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.83 
 
 
374 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.68 
 
 
353 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  51.57 
 
 
332 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  41.83 
 
 
354 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  53.09 
 
 
350 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 
353 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.02 
 
 
353 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  43.48 
 
 
366 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  45.31 
 
 
379 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  45.37 
 
 
366 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  44.74 
 
 
360 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  44.51 
 
 
381 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  41.36 
 
 
356 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  43.3 
 
 
360 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>