More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1836 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  100 
 
 
364 aa  745    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  59.31 
 
 
350 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.53 
 
 
347 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  54.05 
 
 
356 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  54.65 
 
 
359 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  55.46 
 
 
366 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  53.49 
 
 
359 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  53.37 
 
 
348 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  53.49 
 
 
356 aa  362  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  52.31 
 
 
356 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  54.29 
 
 
363 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.24 
 
 
363 aa  358  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  53.2 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  53.1 
 
 
339 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  53.39 
 
 
368 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  52.44 
 
 
360 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  52.44 
 
 
360 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  52.44 
 
 
360 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  48.84 
 
 
362 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  52.44 
 
 
363 aa  348  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  53.33 
 
 
356 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  52.65 
 
 
342 aa  348  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  52.82 
 
 
342 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  52.44 
 
 
365 aa  346  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  51.86 
 
 
360 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  51.86 
 
 
360 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2706  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54 
 
 
347 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.251131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.34 
 
 
351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  50.83 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  47.7 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.6 
 
 
359 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 
372 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  51.1 
 
 
358 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  50.32 
 
 
347 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  50.81 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.41 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.15 
 
 
352 aa  305  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.31 
 
 
359 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  50.15 
 
 
344 aa  305  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.02 
 
 
384 aa  305  7e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.93 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.66 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.3 
 
 
355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  54.55 
 
 
352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  47.75 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  54.2 
 
 
352 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  54.04 
 
 
352 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.74 
 
 
379 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  45.93 
 
 
353 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.58 
 
 
382 aa  299  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  47.01 
 
 
353 aa  299  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  46.15 
 
 
353 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  46.86 
 
 
381 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.11 
 
 
355 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.17 
 
 
408 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  51.55 
 
 
364 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.45 
 
 
352 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.41 
 
 
370 aa  296  5e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  51.2 
 
 
363 aa  296  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.46 
 
 
383 aa  296  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 
360 aa  296  5e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.35 
 
 
355 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.17 
 
 
381 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  48.08 
 
 
353 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  45.87 
 
 
353 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8158  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  45.71 
 
 
377 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
349 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.43 
 
 
360 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.13 
 
 
353 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 
353 aa  293  5e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.11 
 
 
355 aa  291  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
353 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.48 
 
 
357 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.06 
 
 
358 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  49.06 
 
 
362 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.91 
 
 
372 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.54 
 
 
370 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.22 
 
 
381 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  46.99 
 
 
342 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.81 
 
 
353 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.41 
 
 
354 aa  290  3e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.26 
 
 
362 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
377 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
343 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.32 
 
 
382 aa  290  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.44 
 
 
373 aa  289  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  44.54 
 
 
350 aa  288  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  43.66 
 
 
349 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  44.76 
 
 
384 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  44.64 
 
 
346 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.48 
 
 
349 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.17 
 
 
372 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.55 
 
 
362 aa  287  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  44.64 
 
 
346 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.38 
 
 
378 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.17 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  43.36 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.01 
 
 
382 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  47.12 
 
 
353 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.4 
 
 
370 aa  286  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>