More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3307 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  99.71 
 
 
346 aa  694    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  100 
 
 
346 aa  697    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5307  ABC transporter related  71.99 
 
 
355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.853728 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  56.2 
 
 
349 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  54.42 
 
 
350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  51.76 
 
 
379 aa  325  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3217  ABC transporter related  52.82 
 
 
356 aa  323  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257824  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  46.93 
 
 
353 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  42.78 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  48.33 
 
 
353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 
366 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
366 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
366 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  42.78 
 
 
366 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  47.4 
 
 
334 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  47.75 
 
 
368 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  47.56 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.47 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  48.55 
 
 
334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  45 
 
 
355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.9 
 
 
351 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2848  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  44.05 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.59 
 
 
351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.06 
 
 
355 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
365 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  48.02 
 
 
350 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  48.02 
 
 
350 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 
365 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  48.02 
 
 
350 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  46.94 
 
 
338 aa  302  7.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 
356 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  47.53 
 
 
403 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
370 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  46.52 
 
 
356 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.78 
 
 
355 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
376 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  47.34 
 
 
356 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
376 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  48.42 
 
 
364 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  46.94 
 
 
336 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  45.01 
 
 
365 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.78 
 
 
357 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  47.54 
 
 
333 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.73 
 
 
376 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 
376 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  47.74 
 
 
368 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.01 
 
 
376 aa  299  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.43 
 
 
366 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  45.6 
 
 
355 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.5 
 
 
357 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  46.24 
 
 
344 aa  299  6e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.92 
 
 
356 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.92 
 
 
356 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  42.25 
 
 
363 aa  298  8e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  46.94 
 
 
356 aa  298  8e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  44.86 
 
 
365 aa  298  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  46.13 
 
 
355 aa  298  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  45.81 
 
 
385 aa  298  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  43.56 
 
 
370 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 
356 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  43.32 
 
 
370 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  46.38 
 
 
338 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  45.3 
 
 
356 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2481  ABC transporter related  50.54 
 
 
316 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869915  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.19 
 
 
352 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2551  ABC transporter related  49.12 
 
 
347 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  49.85 
 
 
325 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  46.93 
 
 
351 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.09 
 
 
378 aa  297  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  48.6 
 
 
358 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
335 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.97 
 
 
369 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.65 
 
 
356 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
357 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  47.25 
 
 
332 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  47.59 
 
 
370 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.96 
 
 
356 aa  296  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  45.98 
 
 
334 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
377 aa  295  6e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  44.6 
 
 
355 aa  295  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.36 
 
 
364 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  43.89 
 
 
363 aa  295  7e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.02 
 
 
351 aa  295  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2287  ABC transporter related  46.55 
 
 
362 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 
368 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  43.13 
 
 
367 aa  294  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1655  ABC transporter related  44.88 
 
 
361 aa  294  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  49.36 
 
 
361 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  49.54 
 
 
325 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.9 
 
 
386 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 
373 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>