More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3162 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  100 
 
 		 341 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  80.53 
 
 		 342 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  50.81 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  49.5 
 
 		 372 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  46.42 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  49.17 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  43.68 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  50.82 
 
 		 339 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 343 aa  288  8e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  47.58 
 
 		 350 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  48.24 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  45.32 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  47.51 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.72 
 
 		 373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  55.42 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.72 
 
 		 423 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  49.04 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  45.05 
 
 		 350 aa  281  2e-74  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.38 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  46.18 
 
 		 366 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  48.82 
 
 		 367 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 342 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  48.09 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  46.71 
 
 		 353 aa  278  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  54.88 
 
 		 350 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  49.04 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  46.84 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  52.17 
 
 		 353 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.78 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  46.22 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  43.56 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  47.09 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  47.63 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  47.12 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.07 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  54.39 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.21 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  53.2 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.92 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  49.03 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  53.78 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  44.28 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.78 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.78 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.01 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  50.16 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  43.57 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.46 
 
 		 370 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.73 
 
 		 372 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.59 
 
 		 382 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.15 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  45.85 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.82 
 
 		 374 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.82 
 
 		 382 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.71 
 
 		 384 aa  271  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  48.85 
 
 		 358 aa  271  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  45.61 
 
 		 365 aa  271  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.01 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.63 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.92 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.56 
 
 		 382 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  45.54 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  45.54 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  47 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  49.67 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.48 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  55.14 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.04 
 
 		 366 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  46.27 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.48 
 
 		 377 aa  269  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.78 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.33 
 
 		 378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  42.02 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  46.96 
 
 		 353 aa  268  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.12 
 
 		 378 aa  268  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  46.77 
 
 		 353 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.12 
 
 		 378 aa  268  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.12 
 
 		 378 aa  268  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.12 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.12 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.12 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.12 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.89 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  52.5 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  56.12 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  46.18 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.12 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  58.3 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  48.85 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  56.17 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  42.86 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50 
 
 		 352 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  56.17 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  58.3 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  47.04 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  58.3 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.416806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>