More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4695 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  100 
 
 
350 aa  708    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  63.64 
 
 
363 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  63.07 
 
 
363 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  62.68 
 
 
376 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  62.64 
 
 
379 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  59.83 
 
 
362 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  54.82 
 
 
387 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0544  ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 
403 aa  323  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0891201  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  53.96 
 
 
370 aa  323  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5190  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  52.12 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  48.38 
 
 
333 aa  318  7e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0328  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  51.84 
 
 
352 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.785101 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4610  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  53.12 
 
 
380 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  0.957495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4476  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  53.12 
 
 
380 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.041416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  61.44 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  61.44 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  61.44 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  61.44 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  61.44 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  60.59 
 
 
333 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5137  ABC transporter, ATP-binding protein  51.86 
 
 
352 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.94 
 
 
359 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  54.31 
 
 
368 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  54.31 
 
 
368 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5010  ABC transporter related  52.17 
 
 
352 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118547  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.61 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.61 
 
 
356 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.15 
 
 
353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  52.8 
 
 
352 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  54.52 
 
 
367 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  52.48 
 
 
352 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  52.17 
 
 
352 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5369  ABC transporter-like  51.46 
 
 
358 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  57.61 
 
 
361 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  50.64 
 
 
357 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  50.32 
 
 
357 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  54.13 
 
 
360 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.03 
 
 
372 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  53.42 
 
 
344 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  46.59 
 
 
366 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.23 
 
 
353 aa  295  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  52.6 
 
 
349 aa  295  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5523  ABC transporter related  55.23 
 
 
364 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  50.64 
 
 
346 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  50.64 
 
 
346 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  50.64 
 
 
346 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  53.12 
 
 
356 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.92 
 
 
353 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  52.73 
 
 
366 aa  292  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  46.22 
 
 
399 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.82 
 
 
352 aa  292  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.71 
 
 
370 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  48.55 
 
 
348 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  58.26 
 
 
353 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  47.73 
 
 
337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  52.61 
 
 
356 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  50.81 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  57.85 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.14 
 
 
359 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  49.53 
 
 
347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.82 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2197  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.7 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171508  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  53.29 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  49.67 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  49.34 
 
 
336 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  47.32 
 
 
356 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  49.02 
 
 
358 aa  279  5e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  48.31 
 
 
336 aa  278  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  48.25 
 
 
347 aa  278  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.07 
 
 
345 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  45.35 
 
 
357 aa  278  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  47.94 
 
 
348 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  46.02 
 
 
353 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.22 
 
 
356 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.39 
 
 
339 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 
357 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  45.61 
 
 
359 aa  276  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.13 
 
 
351 aa  276  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.82 
 
 
353 aa  275  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  50.16 
 
 
367 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
365 aa  275  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  47.39 
 
 
356 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.45 
 
 
360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  52.35 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1283  ABC transporter related  52.23 
 
 
357 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  53.06 
 
 
386 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  39.6 
 
 
350 aa  272  6e-72  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  43.71 
 
 
385 aa  272  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.79 
 
 
357 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  45.43 
 
 
339 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.68 
 
 
372 aa  271  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  46.73 
 
 
356 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 
343 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  50.53 
 
 
354 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  39.56 
 
 
367 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.48 
 
 
384 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  50.16 
 
 
352 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  43.52 
 
 
343 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  45.72 
 
 
339 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>