More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1101 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  100 
 
 
333 aa  671    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0755  ABC transporter, ATP-binding protein  69.3 
 
 
329 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.547928  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0832  ABC transporter, ATP-binding protein  70.3 
 
 
317 aa  378  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.83 
 
 
329 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  52.89 
 
 
329 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  52.42 
 
 
331 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  53.66 
 
 
328 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.12 
 
 
331 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  54.41 
 
 
330 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  55 
 
 
329 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  54.41 
 
 
330 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  53.66 
 
 
329 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  53.35 
 
 
329 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  52.76 
 
 
330 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  53.66 
 
 
329 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  53.35 
 
 
329 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  50.45 
 
 
339 aa  333  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  51.04 
 
 
339 aa  328  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 
353 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 
353 aa  296  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.36 
 
 
353 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.4 
 
 
352 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 
356 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 
353 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  42.77 
 
 
366 aa  291  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.87 
 
 
356 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.7 
 
 
359 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  42.94 
 
 
344 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  40.9 
 
 
353 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  45.98 
 
 
353 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.63 
 
 
370 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.9 
 
 
353 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  41.67 
 
 
352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  41.96 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  42.37 
 
 
353 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  40.6 
 
 
349 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.14 
 
 
362 aa  280  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 
372 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  41.38 
 
 
358 aa  280  3e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  41.59 
 
 
352 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
360 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  41.11 
 
 
386 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  49.14 
 
 
329 aa  275  8e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  42.12 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  42.42 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  46.13 
 
 
356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  47.22 
 
 
333 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  44 
 
 
341 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  50.8 
 
 
363 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  43.49 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  39.83 
 
 
357 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  46.75 
 
 
350 aa  269  5e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  46.88 
 
 
333 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  42.58 
 
 
350 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  39.53 
 
 
342 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  50 
 
 
371 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  49.58 
 
 
342 aa  268  1e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 
333 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  46.26 
 
 
347 aa  267  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.69 
 
 
354 aa  267  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.79 
 
 
359 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  42.19 
 
 
344 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
337 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.59 
 
 
426 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.26 
 
 
360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 
333 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  40.66 
 
 
359 aa  265  8e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.35 
 
 
377 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.71 
 
 
372 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  44.73 
 
 
354 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 
333 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.9 
 
 
378 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  37.91 
 
 
348 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50 
 
 
382 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  41.64 
 
 
349 aa  262  6.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.79 
 
 
378 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.79 
 
 
378 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.79 
 
 
378 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 
349 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  40.59 
 
 
347 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.18 
 
 
372 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  44.37 
 
 
361 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
348 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0375  ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 
316 aa  260  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 
349 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  41.14 
 
 
365 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.37 
 
 
378 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.37 
 
 
378 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.37 
 
 
378 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.37 
 
 
378 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  49.37 
 
 
378 aa  260  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  43.73 
 
 
353 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.37 
 
 
378 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  42.95 
 
 
323 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  38.69 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.21 
 
 
371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  40.31 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>