More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0375 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0375  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 316 aa  633    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0053  ABC transporter related  53.53 
 
 		 309 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.916211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2481  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 325 aa  275  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  45.34 
 
 		 342 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42.32 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.03 
 
 		 352 aa  264  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  51.45 
 
 		 350 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  44.34 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  42.53 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  48.55 
 
 		 344 aa  261  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  50 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  43.55 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  45.95 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.36 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 348 aa  258  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  42.44 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  54.2 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  47.7 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.7 
 
 		 352 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 355 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  47.7 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  47.03 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  47.28 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  39.42 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  51.64 
 
 		 323 aa  255  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.58 
 
 		 372 aa  255  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  36.65 
 
 		 366 aa  255  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  47.7 
 
 		 349 aa  255  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  48.68 
 
 		 339 aa  255  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  49.59 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.38 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  43.99 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  43.94 
 
 		 331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  47.28 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  45.61 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  46.72 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  45.74 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  42.47 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  47.28 
 
 		 337 aa  252  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.32 
 
 		 370 aa  252  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 		 351 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  37.57 
 
 		 336 aa  251  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  42.42 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  45.2 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.81 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.5 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.23 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  47.64 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.02 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  37.34 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  50.85 
 
 		 349 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  37.34 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.63 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  37.34 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  41.35 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  47.27 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  40.91 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.63 
 
 		 358 aa  248  7e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 343 aa  248  9e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  50.88 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.31 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  47.3 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  49.15 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.72 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.57 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.75 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.54 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  47.62 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.35 
 
 		 380 aa  246  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  46.31 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  41.56 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 349 aa  246  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  39.2 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  46.09 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  46.22 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.05 
 
 		 382 aa  245  6e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 347 aa  245  6e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  45.45 
 
 		 353 aa  245  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.03 
 
 		 363 aa  245  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  48.5 
 
 		 370 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.01 
 
 		 343 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 		 329 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.48 
 
 		 363 aa  244  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  41.03 
 
 		 329 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.91 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  36.98 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1925  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  45.23 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.43 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>