More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1314 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  100 
 
 		 329 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  97.26 
 
 		 329 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  97.26 
 
 		 329 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  93.92 
 
 		 329 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  84.5 
 
 		 329 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  81.85 
 
 		 329 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  82.15 
 
 		 329 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  76.6 
 
 		 328 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  76.13 
 
 		 331 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  76.13 
 
 		 331 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  71.52 
 
 		 330 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  69.7 
 
 		 330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  69.39 
 
 		 330 aa  447  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  58.41 
 
 		 339 aa  391  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  56.68 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  53.66 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0755  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 329 aa  352  4e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.547928  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0832  ABC transporter, ATP-binding protein  57.57 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  49.4 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.17 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.26 
 
 		 370 aa  298  8e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.31 
 
 		 352 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.22 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.8 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.24 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  46.33 
 
 		 353 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  46.63 
 
 		 353 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  46.06 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.16 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.16 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.16 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.16 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  50.16 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.16 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.51 
 
 		 359 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  47.85 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.16 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.16 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.16 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  48.34 
 
 		 347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.28 
 
 		 372 aa  281  8.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.73 
 
 		 378 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.73 
 
 		 378 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.73 
 
 		 378 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.73 
 
 		 378 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  56.73 
 
 		 378 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  57.5 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  47.85 
 
 		 352 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  46.84 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.02 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 		 352 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  46.52 
 
 		 336 aa  278  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  45.48 
 
 		 337 aa  277  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  48.47 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  45.06 
 
 		 363 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.55 
 
 		 362 aa  275  9e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  44.44 
 
 		 353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  45.31 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 		 333 aa  272  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  47.8 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.84 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  44.05 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  41.93 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  47.8 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 		 384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  47.15 
 
 		 339 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  45.6 
 
 		 333 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  44.71 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.65 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  52.5 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  53.56 
 
 		 371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  42.77 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.61 
 
 		 426 aa  265  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.16 
 
 		 372 aa  265  8.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  45.76 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.2 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  46.82 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.97 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  42.54 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  39.77 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  46.89 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  46.49 
 
 		 364 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  46.47 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.47 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.2 
 
 		 378 aa  262  6e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.85 
 
 		 376 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  46.1 
 
 		 348 aa  261  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  41.69 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  44.38 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.34 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>