More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0668 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 341 aa  691    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  63.45 
 
 		 342 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  61.7 
 
 		 342 aa  424  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  63.4 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  62.36 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  62.57 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  62.93 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  62.93 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  62.36 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  62.36 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  60 
 
 		 349 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  59.89 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  60 
 
 		 349 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  60.29 
 
 		 349 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  60 
 
 		 349 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 346 aa  315  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  50.98 
 
 		 343 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 343 aa  308  9e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  48.41 
 
 		 350 aa  299  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  46.11 
 
 		 369 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  47.23 
 
 		 368 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  45.16 
 
 		 369 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  46.85 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  47.15 
 
 		 357 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  43.48 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  45.91 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  43.54 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  47.23 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  45.06 
 
 		 369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  44.62 
 
 		 366 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  43.06 
 
 		 369 aa  268  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  41.48 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.98 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  46.21 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  41.52 
 
 		 358 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.69 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  41.74 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  43.57 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.81 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  39.88 
 
 		 387 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  43.23 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  42.44 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  39.71 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  44.04 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  46.65 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  44.04 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  42.69 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  43.28 
 
 		 346 aa  252  8.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  41.01 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.77 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  43.53 
 
 		 375 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  41.45 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  50.4 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  43.79 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  52.38 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  52.38 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  41.57 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  41.91 
 
 		 354 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  41.25 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.95 
 
 		 257 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  51.95 
 
 		 257 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.19 
 
 		 355 aa  242  9e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.21 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  40.62 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  41.4 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  38.76 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  40.51 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  42.2 
 
 		 410 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  51.08 
 
 		 257 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  40.64 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  39.47 
 
 		 405 aa  239  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  40.64 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  51.52 
 
 		 257 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.74 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  41.36 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  41.91 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  40.49 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  40.13 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  40 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  46.95 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  38.68 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  37.65 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  39.81 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  38.37 
 
 		 364 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.18 
 
 		 367 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.87 
 
 		 370 aa  235  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  42.42 
 
 		 356 aa  235  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  42.02 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.42 
 
 		 259 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 		 339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.18 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>